JBPC Publications: 2011 - 2018

Top 25 Journals

Proc Natl Acad Sci U S A(56),ISME J(33),PLoS One(31),Appl Environ Microbiol(29),Environ Microbiol(26),Mol Biol Evol(24),Front Microbiol(21),Nucleic Acids Res(18),J Bacteriol(17),Biol Bull(17),Microbiome(15),Science(14),J Biol Chem(14),J Mol Biol(13),Nature(11),BMC Genomics(11),bioRxiv(10),J Eukaryot Microbiol(10),Genetics(10),mSystems(9),Hydrobiologia(9),European Journal of Protistology(9),MBio(8),Limnology and Oceanography(8),Gene(8)

Years

2018(32) | 2017(37) | 2016(49) | 2015(58) | 2014(68) | 2013(42) | 2012(47) | 2011(42) | 2000-2010 | 1996-1999

2018

Abrams, J. M.,Arkhipova, I. R.,, Boeke, J. D., Joan Curcio, M., Faulkner, G. J., Goodier, J. L., Lehmann, R., & Levin, H. L. (2018). “” Mob DNA, 9(ARTN 21), 21. doi:10.1186/s13100-018-0126-.

Amaral-Zettler, L. A., Schmidt, V., & Smith, K. F. (2018). “” Microorganisms, 6(3). doi:10.3390/microorganisms603009.

Arkhipova, I. R.(2018). “” Mol Biol Evol, 35(6), 1332-1337. doi:10.1093/molbev/msy08.

Bowers, R. M., Kyrpides, N. C., Stepanauskas, R., Harmon-Smith, M., Doud, D., Reddy, T. B. K., Schulz, F., Jarett, J., Rivers, A. R., Eloe-Fadrosh, E. A., Tringe, S. G., Ivanova, N. N., Copeland, A., Clum, A., Becraft, E. D., Malmstrom, R. R., Birren, B., Podar, M., Bork, P., Weinstock, G. M., Garrity, G. M., Dodsworth, J. A., Yooseph, S., Sutton, G., Glockner, F. O.,, Nelson, W. C., Hallam, S. J., Jungbluth, S. P., Ettema, T. J. G., Tighe, S., Konstantinidis, K. T., Liu, W. T., Baker, B. J., Rattei, T., Eisen, J. A., Hedlund, B., McMahon, K. D., Fierer, N., Knight, R., Finn, R., Cochrane, G., Karsch-Mizrachi, I., Tyson, G. W., Rinke, C., Genome Standards, C., Lapidus, A., Meyer, F., Yilmaz, P., Parks, D. H.,, Schriml, L., Banfield, J. F., Hugenholtz, P., & Woyke, T. (2018). “” Nat Biotechnol, 36(2), 196. doi:10.1038/nbt0218-196.

Burnett, K., Edsinger, E., & Albrecht, D. R. (2018). “” Commun Biol, 1(1), 73. doi:10.1038/s42003-018-0079-.

Chafee, M., Fernandez-Guerra, A., Buttigieg, P. L., Gerdts, G.,, Teeling, H., & Amann, R. I. (2018). “” ISME J, 12(1), 237-252. doi:10.1038/ismej.2017.16.

Chernikova, D. A., Madan, J. C., Housman, M. L., Zain-Ul-Abideen, M., Lundgren, S. N.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Williams, S. M., Moore, J. H., Karagas, M. R., & Hoen, A. G. (2018). “” Pediatr Res, 84(1), 71-79. doi:10.1038/s41390-018-0022-.

Crognale, S., Venturi, S., Tassi, F., Rossetti, S., Rashed, H., Cabassi, J., Capecchiacci, F., Nisi, B., Vaselli, O.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., & Fazi, S. (2018). “” FEMS Microbiol Ecol, 94(12), fiy190-fiy190. doi:10.1093/femsec/fiy19.

Delmont, T. O., & (2018). “” PeerJ, 6(ARTN e4320), e4320. doi:10.7717/peerj.432.

Delmont, T. O., Quince, C., Shaiber, A., Esen, O. C., Lee, S. T., Rappe, M. S., McLellan, S. L., Lucker, S., & (2018). “” Nat Microbiol, 3(7), 804-813. doi:10.1038/s41564-018-0176-.

Dever, K., Carr, J., Girard, J., Calzarette, D., Remsen, D., Gage, G., Chugunov, I., Weissbourd, B., Cordeiro, M., Miao, J., Marvel-Zuccola, J., Newstein, P., Peramba, K., & Edsinger, E. (2018). “” Paper presented at the Annual Meeting of the Society for Integrative and Comparative Biology, San Francisco, CA.

Edsinger, E., & Dolen, G. (2018). “” Curr Biol, 28(19), 3136-3142 e3134. doi:10.1016/j.cub.2018.07.06.

Frere, L.,Maignien, L., Chalopin, M., Huvet, A., Rinnert, E., Morrison, H., Kerninon, S., Cassone, A. L., Lambert, C.,, & Paul-Pont, I. (2018). “” Environ Pollut, 242(Pt A), 614-625. doi:10.1016/j.envpol.2018.07.02.

(2018). “” mSystems, 3(2). doi:10.1128/mSystems.00002-1.

Grahl, N., Dolben, E. L., Filkins, L. M., Crocker, A. W., Willger, S. D.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Ashare, A., Gifford, A. H., Jacobs, N. J., Schwartzman, J. D., & Hogan, D. A. (2018). “” mSphere, 3(4). doi:10.1128/mSphere.00292-1.

Gribble, K. E., Moran, B. M., Jones, S., Corey, E. L., & Mark Welch, D. B.(2018). “” Exp Gerontol, 114, 99-106. doi:10.1016/j.exger.2018.10.02.

Hecox-Lea, B. J., & Mark Welch, D. B.(2018). “” BMC Evol Biol, 18(1), 177. doi:10.1186/s12862-018-1288-.

Hoen, A. G., Madan, J. C., Li, Z., Coker, M., Lundgren, S. N.,Morrison, H. G., Palys, T., Jackson, B. P.,Sogin, M. L., Cottingham, K. L., & Karagas, M. R. (2018). “” Sci Rep, 8(1), 12627. doi:10.1038/s41598-018-30581-.

Hubbard, C. J., Brock, M. T., van Diepen, L. T.,Maignien, L., Ewers, B. E., & Weinig, C. (2018). “” ISME J, 12, 400-410.

Kroeger, M. E., Delmont, T. O.,, Meyer, K. M., Guo, J., Khan, K., Rodrigues, J. L. M., Bohannan, B. J. M., Tringe, S. G., Borges, C. D., Tiedje, J. M., Tsai, S. M., & Nusslein, K. (2018). “” Front Microbiol, 9(ARTN 1635), 1635. doi:10.3389/fmicb.2018.0163.

Lang, J. M., Coil, D. A., Neches, R. Y., Brown, W. E., Cavalier, D., Severance, M., Hampton-Marcell, J. T.,, & Eisen, J. A. (2018). “” PeerJ, 5. doi:10.7717/peerj.4029/correction-.

Lundgren, S. N., Madan, J. C., Emond, J. A.,Morrison, H. G., Christensen, B. C., Karagas, M. R., & Hoen, A. G. (2018). “” Microbiome, 6(1), 109. doi:10.1186/s40168-018-0490-.

McIntosh, C. M., Chen, L., Shaiber, A.,, & Alegre, M. L. (2018). “” Microbiome, 6(1), 96. doi:10.1186/s40168-018-0474-.

Meisel, M., Hinterleitner, R., Pacis, A., Chen, L., Earley, Z. M., Mayassi, T., Pierre, J. F., Ernest, J. D., Galipeau, H. J., Thuille, N., Bouziat, R., Buscarlet, M., Ringus, D. L., Wang, Y., Li, Y., Dinh, V., Kim, S. M., McDonald, B. D., Zurenski, M. A., Musch, M. W., Furtado, G. C., Lira, S. A., Baier, G., Chang, E. B.,, Weber, C. R., Busque, L., Godley, L. A., Verdu, E. F., Barreiro, L. B., & Jabri, B. (2018). “” Nature, 557(7706), 580-584. doi:10.1038/s41586-018-0125-.

Peñalver Bernabé, B., Cralle, L., & (2018). “” Curr Opin Biotechnol, 51, 146-153. doi:10.1016/j.copbio.2018.01.01.

Quigley, C. T. C.,Morrison, H. G., Mendonca, I. R., & Brawley, S. H. (2018). “” J Phycol, 54(5), 653-664. doi:10.1111/jpy.1276.

Rodriguez, F., & Arkhipova, I. R.(2018). “” Curr Opin Genet Dev, 49, 115-123. doi:10.1016/j.gde.2018.04.00.

Seyler, L. M., McGuinness, L. R.,, Biddle, J. F., Gong, D., & Kerkhof, L. J. (2018). “” FEMS Microbiol Ecol, 94(3). doi:10.1093/femsec/fiy01.

Sheik, C. S., Reese, B. K., Twing, K. I., Sylvan, J. B.,Grim, S. L., Schrenk, M. O.,Sogin, M. L., & Colwell, F. S. (2018). “” Front Microbiol, 9(ARTN 840), 840. doi:10.3389/fmicb.2018.0084.

Vakhrusheva, O. A., Mnatsakanova, E. A., Galimov, Y. R., Neretina, T. V., Gerasimov, E. S., Ozerova, S. G., Zalevsky, A. O.,Yushenova, I. A.,Arkhipova, I. R., Penin, A. A., Logacheva, M. D., Bazykin, G. A., & Kondrashov, A. S. (2018). “” bioRxiv, 489393. doi:10.1101/48939.

Yushenova, I. A., & Arkhipova, I. R.(2018). “” Curr Genet, 64(6), 1287-1301. doi:10.1007/s00294-018-0844-.

Zhang, X., Xia, K., Lin, L., Zhang, F., Yu, Y., St Ange, K., Han, X., Edsinger, E., Sohn, J., & Linhardt, R. J. (2018). “” ACS Chem Biol, 13(6), 1677-1685. doi:10.1021/acschembio.8b0033.

2017

Amaral-Zettler, L. A., Dragone, N. B., Schell, J., Slikas, B.,Murphy, L. G., Morrall, C. E., & Zettler, E. R. (2017). “Comparative mitochondrial and chloroplast genomics of a genetically distinct form of Sargassum contributing to recent “Golden Tides” in the Western Atlantic.” Ecol Evol, 7(2), 516-525. doi:10.1002/ece3.263.

Anderson, R. E.,,, Delmont, T. O.,, McDermott, J. M., Seewald, J. S., & (2017). “” Nat Commun, 8(1), 1114. doi:10.1038/s41467-017-01228-.

Arkhipova, I. R.,Yushenova, I. A., & Rodriguez, F.(2017). “” Mol Biol Evol, 34(9), 2245-2257. doi:10.1093/molbev/msx15.

Bowers, R. M., Kyrpides, N. C., Stepanauskas, R., Harmon-Smith, M., Doud, D., Reddy, T. B. K., Schulz, F., Jarett, J., Rivers, A. R., Eloe-Fadrosh, E. A., Tringe, S. G., Ivanova, N. N., Copeland, A., Clum, A., Becraft, E. D., Malmstrom, R. R., Birren, B., Podar, M., Bork, P., Weinstock, G. M., Garrity, G. M., Dodsworth, J. A., Yooseph, S., Sutton, G., Glockner, F. O.,, Nelson, W. C., Hallam, S. J., Jungbluth, S. P., Ettema, T. J. G., Tighe, S., Konstantinidis, K. T., Liu, W. T., Baker, B. J., Rattei, T., Eisen, J. A., Hedlund, B., McMahon, K. D., Fierer, N., Knight, R., Finn, R., Cochrane, G., Karsch-Mizrachi, I., Tyson, G. W., Rinke, C., Lapidus, A., Meyer, F., Yilmaz, P., Parks, D. H.,, Schriml, L., Banfield, J. F., Hugenholtz, P., Woyke, T., & Consortium, G. S. (2017). “” Nature Biotechnology, 35(8), 725-731. doi:10.1038/nbt.389.

Bowman, J. S.,Amaral-Zettler, L. A., J, J. R., C, M. L., & Ducklow, H. W. (2017). “” ISME J, 11(6), 1460-1471. doi:10.1038/ismej.2016.20.

Courtine, D., Alain, K., Georges, M., Bienvenu, N.,Morrison, H. G.,, & Maignien, L.(2017). “” EXT12c, Isolated from the East Pacific Rise 9 degrees N. Genome Announc, 5(50). doi:10.1128/genomeA.01385-1.

De Tender, C., Schlundt, C., Devriese, L. I., Mincer, T. J., Zettler, E. R., & Amaral-Zettler, L. A.(2017). “” Analytical Methods, 9(14), 2132-2143. doi:10.1039/c7ay00260.

Delmont, T. O., & (2017). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 114(43), E8947-E8949. doi:10.1073/pnas.171218611.

Devetter, M., Fontaneto, D., Jersabek, C. D.,Mark Welch, D. B., May, L., & Walsh, E. J. (2017). “” Hydrobiologia, 796(1), 1-6. doi:10.1007/s10750-017-3241-.

Doherty, M., Yager, P. L., Moran, M. A., Coles, V. J.,, Krusche, A. V., Medeiros, P. M., Payet, J. P., Richey, J. E., Satinsky, B. M., Sawakuchi, H. O., Ward, N. D., & Crump, B. C. (2017). “” Front Microbiol, 8, 882. doi:10.3389/fmicb.2017.0088.

Fan, K. K., Cardona, C., Li, Y. T., Shi, Y., Xiang, X. J., Shen, C. C., Wang, H. F.,, & Chu, H. Y. (2017). “” Soil Biology & Biochemistry, 113(Supplement C), 275-284. doi:10.1016/j.soilbio.2017.06.02.

Franco-Obregon, A., & (2017). “” mSystems, 2(3). doi:10.1128/mSystems.00018-1.

Gibbons, S. M., Lekberg, Y., Mummey, D. L., Sangwan, N., Ramsey, P. W., & (2017). “” mSystems, 2(2). doi:10.1128/mSystems.00178-1.

(2017). “” Microb Biotechnol, 10(1), 11-13. doi:10.1111/1751-7915.1243.

Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B.(2017). “” BMC Genomics, 18(1), 217. doi:10.1186/s12864-017-3540-.

Hasegawa, Y.,Mark Welch, J. L., Rossetti, B. J., & (2017). “” PLoS One, 12(11), e0188257. doi:10.1371/journal.pone.018825.

Herfort, L., Crump, B. C.,, McCue, L. A., Campbell, V., Simon, H. M., Baptista, A. M., & Zuber, P. (2017). “” Microbiologyopen, 6(6), e00522-n/a. doi:10.1002/mbo3.52.

Huang, Y., Dalal, S., Antonopoulos, D., Hubert, N., Raffals, L. H., Dolan, K., Weber, C., Messer, J. S., Jabri, B., Bendelac, A.,, Rubin, D. T., Sogin, M., & Chang, E. B. (2017). “” Inflamm Bowel Dis, 23(3), 366-378. doi:10.1097/MIB.000000000000102.

Knight, R., Callewaert, C., Marotz, C., Hyde, E. R., Debelius, J. W., McDonald, D., & Sogin, M. L.(2017). “” Annu Rev Genomics Hum Genet, 18, 65-86. doi:10.1146/annurev-genom-083115-02243.

Kumar, R., Verma, H., Haider, S., Bajaj, A., Sood, U., Ponnusamy, K., Nagar, S., Shakarad, M. N., Negi, R. K., Singh, Y., Khurana, J. P.,, & Lal, R. (2017). “” mSystems, 2(3). doi:10.1128/mSystems.00020-1.

Kuntz, T. M., & (2017). “” Trends Pharmacol Sci, 38(1), 81-91. doi:10.1016/j.tips.2016.10.00.

Lee, S. T. M., Kahn, S. A., Delmont, T. O., Shaiber, A., Esen, O. C., Hubert, N. A.,Morrison, H. G., Antonopoulos, D. A., Rubin, D. T., & (2017). “” Microbiome, 5(1), 50. doi:10.1186/s40168-017-0270-.

Luria, C. M.,Amaral-Zettler, L. A., Ducklow, H. W., Repeta, D. J., Rhyne, A., & Rich, J. J. (2017). “” Frontiers in Microbiology-Aquatic Microbiology, 8, 2117.

Ma, B., Dai, Z., Wang, H., Dsouza, M., Liu, X., He, Y., Wu, J., Rodrigues, J. L.,, Brookes, P. C., & Xu, J. (2017). “” mSystems, 2(1). doi:10.1128/mSystems.00174-1.

Mackey, K. R. M., Hunter-Cevera, K., Britten, G. L.,Murphy, L. G.,Sogin, M. L., & (2017). “” Front Microbiol, 8, 1496. doi:10.3389/fmicb.2017.0149.

Mark Welch, D. B., Jauch, A., Langowski, J., Olins, A. L., & Olins, D. E. (2017). “” Nucleus, 8(2), 222-237. doi:10.1080/19491034.2017.128598.

Mark Welch, J. L.,Hasegawa, Y., McNulty, N. P., Gordon, J. I., & (2017). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 114(43), E9105-E9114. doi:10.1073/pnas.171159611.

Perez, T.,Rodriguez, F., Fernandez, M., Albornoz, J., & Dominguez, A. (2017). “” Gene, 628(Supplement C), 63-71. doi:10.1016/j.gene.2017.07.03.

Quince, C., Delmont, T. O., Raguideau, S., Alneberg, J., Darling, A. E., Collins, G., & (2017). “” Genome Biol, 18(1), 181. doi:10.1186/s13059-017-1309-.

Rodriguez, F., Kenefick, A. W., & Arkhipova, I. R.(2017). “” Viruses, 9(4). doi:10.3390/v904007.

Schmidt, V., Gomez-Chiarri, M., Roy, C., Smith, K., & Amaral-Zettler, L. A.(2017). “” Msystems, 2(6). doi:UNSP e00133-17 10.1128/mSystems.00133-1.

Smith, M. W., Herfort, L.,, Crump, B. C., & Simon, H. M. (2017). “” Microbiologyopen, 6(4). doi:10.1002/mbo3.46.

Stellato, G., Utter, D. R.,Voorhis, A., De Angelis, M.,, & Ercolini, D. (2017). “” Front Microbiol, 8, 264. doi:10.3389/fmicb.2017.0026.

Sylvan, J. B., Wankel, S. D., LaRowe, D. E., Charoenpong, C. N.,, Moyer, C. L., & Edwards, K. J. (2017). “” Geochimica Et Cosmochimica Acta, 198, 131-150. doi:10.1016/j.gca.2016.10.02.

Teif, V. B., Mallm, J. P., Sharma, T.,Mark Welch, D. B., Rippe, K., Eils, R., Langowski, J., Olins, A. L., & Olins, D. E. (2017). “” Nucleus, 8(2), 188-204. doi:10.1080/19491034.2017.129520.

Wilbert, S. A.,Mark Welch, J. L., Dewhirst, F. E., & (2017). “” Paper presented at the ASCB/EMBO Meeting, Philadelphia, PA.

Zettler, E. R., Takada, H., Monteleone, B., Mallos, N., Eriksen, M., & Amaral-Zettler, L. A.(2017). “” Analytical Methods, 9(9), 1392-1403. doi:10.1039/c6ay02716.

2016

Arkhipova, I. R., & Rice, P. A. (2016). “” Mol Ecol, 25(5), 1027-1031. doi:10.1111/mec.1354.

Balint, M., Bahram, M.,, Faust, K., Fuhrman, J. A., Lindahl, B., O’Hara, R. B., Opik, M.,Sogin, M. L., Unterseher, M., & Tedersoo, L. (2016). “” FEMS Microbiol Rev, 40(5), 686-700. doi:10.1093/femsre/fuw01.

Britstein, M., Devescovi, G., Handley, K. M., Malik, A., Haber, M., Saurav, K., Teta, R., Costantino, V., Burgsdorf, I.,, Sher, N., Venturi, V., & Steindler, L. (2016). “” Appl Environ Microbiol, 82(4), 1274-1285. doi:10.1128/aem.03111-1.

Chernikova, D. A., Koestler, D. C., Hoen, A. G., Housman, M. L., Hibberd, P. L., Moore, J. H.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Zain-Ul-Abideen, M., & Madan, J. C. (2016). “” J Matern Fetal Neonatal Med, 29(1), 99-105. doi:10.3109/14767058.2014.98774.

Davies, N., Field, D., Gavaghan, D., Holbrook, S. J., Planes, S., Troyer, M., Bonsall, M., Claudet, J., Roderick, G., Schmitt, R. J.,Amaral-Zettler, L. A., Berteaux, V., Bossin, H. C., Cabasse, C., Collin, A., Deck, J., Dell, T., Dunne, J., Gates, R., Harfoot, M., Hench, J. L., Hopuare, M., Kirch, P., Kotoulas, G., Kosenkov, A., Kusenko, A., Leichter, J. J., Lenihan, H., Magoulas, A., Martinez, N., Meyer, C., Stoll, B., Swalla, B., Tartakovsky, D. M., Murphy, H. T., Turyshev, S., Valdvinos, F., Williams, R., Wood, S., & Consortium, I. (2016). “” Gigascience, 5(1), 14. doi:10.1186/s13742-016-0118-.

De Filippis, F., Genovese, A., Ferranti, P.,, & Ercolini, D. (2016). “” Sci Rep, 6, 21871. doi:10.1038/srep2187.

Delmont, T. O., & (2016). “” PeerJ, 4, e1839. doi:10.7717/peerj.183.

Denner, D. R., Sangwan, N., Becker, J. B., Hogarth, D. K., Oldham, J., Castillo, J., Sperling, A. I., Solway, J., Naureckas, E. T.,, & White, S. R. (2016). “” J Allergy Clin Immunol, 137(5), 1398-1405 e1393. doi:10.1016/j.jaci.2015.10.01.

Dugas, L. R., Fuller, M., Gilbert, J., & Layden, B. T. (2016). “” Emerg Themes Epidemiol, 13, 2. doi:10.1186/s12982-015-0044-.

,Sogin, M. L., & Maignien, L.(2016). “” Frontiers in Microbiology, 7, 1318. doi:ARTN 131810.3389/fmicb.2016.0131.

Fernandez-Gonzalez, N.,, & Vallino, J. J. (2016). “” mSystems, 1(5). doi:10.1128/mSystems.00117-1.

, & (2016). “” ISME J, 10(8), 1925-1938. doi:10.1038/ismej.2015.25.

Gibbons, S. M., Scholz, M., Hutchison, A. L., Dinner, A. R.,, & Coleman, M. L. (2016). “” MBIO, 7(6). doi:10.1128/mBio.01372-1.

(2016). “” mSystems, 1(1). doi:10.1128/mSystems.00015-1.

, & Alverdy, J. (2016). “” Gut, 65(1), 1-2. doi:10.1136/gutjnl-2015-31004.

, Klyczek, K. K., & Elliott, S. L. (2016). “” J Microbiol Biol Educ, 17(1), 1-2. doi:10.1128/jmbe.v17i1.111.

Hogan, D. A., Willger, S. D., Dolben, E. L., Hampton, T. H., Stanton, B. A.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Czum, J., & Ashare, A. (2016). “” PLoS One, 11(3), e0149998. doi:10.1371/journal.pone.014999.

Kaneko, G., Yoshinaga, T.,Gribble, K. E.,Mark Welch, D. B., & Ushio, H. (2016). “” J Vis Exp(113), e54126. doi:10.3791/5412.

Kleindienst, S., Grim, S., Sogin, M., Bracco, A., Crespo-Medina, M., & Joye, S. B. (2016). “” ISME J, 10(2), 400-415. doi:10.1038/ismej.2015.12.

Kleindienst, S., Seidel, M., Ziervogel, K., Grim, S., Loftis, K., Harrison, S., Malkin, S. Y., Perkins, M. J., Field, J.,Sogin, M. L., Dittmar, T., Passow, U., Medeiros, P., & Joye, S. B. (2016). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 113(11), E1422-1423. doi:10.1073/pnas.160049811.

Li, H., Yang, X., Weng, B., Su, J., Nie, S.,, & Zhu, Y. G. (2016). “” SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY, 100, 59-65. doi:10.1016/j.soilbio.2016.05.01.

Liebeskind, B. J., Hillis, D. M., Zakon, H. H., & Hofmann, H. A. (2016). “” Trends Ecol Evol, 31(2), 127-135. doi:10.1016/j.tree.2015.12.00.

Luria, C. M.,Amaral-Zettler, L. A., Ducklow, H. W., & Rich, J. J. (2016). “” Front Microbiol, 7(ARTN 1731), 1731. doi:10.3389/fmicb.2016.0173.

Madan, J. C., Hoen, A. G., Lundgren, S. N., Farzan, S. F., Cottingham, K. L.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Li, H., Moore, J. H., & Karagas, M. R. (2016). “” JAMA PEDIATRICS, 170(3), 212-219. doi:10.1001/jamapediatrics.2015.373.

Mark Welch, J. L., Rossetti, B. J., Rieken, C. W., Dewhirst, F. E., & (2016). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 113(6), E791-800. doi:10.1073/pnas.152214911.

Metcalf, J. L., Xu, Z. Z., Weiss, S., Lax, S., Van Treuren, W., Hyde, E. R., Song, S. J., Amir, A., Larsen, P., Sangwan, N., Haarmann, D., Humphrey, G. C., Ackermann, G., Thompson, L. R., Lauber, C., Bibat, A., Nicholas, C., Gebert, M. J., Petrosino, J. F., Reed, S. C.,, Lynne, A. M., Bucheli, S. R., Carter, D. O., & Knight, R. (2016). “” Science, 351(6269), 158-162. doi:10.1126/science.aad264.

Meyer, J. L., Jaekel, U., Tully, B. J., Glazer, B. T., Wheat, C. G., Lin, H. T., Hsieh, C. C., Cowen, J. P., Hulme, S. M., Girguis, P. R., & (2016). “” Sci Rep, 6, 22541. doi:10.1038/srep2254.

Mills, S., Alcántara-Rodríguez, J. A., Ciros-Pérez, J., Gómez, A., Hagiwara, A., Galindo, K. H., Jersabek, C. D., Malekzadeh-Viayeh, R., Leasi, F., Lee, J.-S.,Mark Welch, D. B., Papakostas, S., Riss, S., Segers, H., Serra, M., Shiel, R., Smolak, R., Snell, T. W., Stelzer, C.-P., Tang, C. Q., Wallace, R. L., Fontaneto, D., & Walsh, E. J. (2016). “” Hydrobiologia, 796(1), 39-58. doi:10.1007/s10750-016-2725-.

O’Brien, S. L., Gibbons, S. M., Owens, S. M., Hampton-Marcell, J., Johnston, E. R., Jastrow, J. D.,, Meyer, F., & Antonopoulos, D. A. (2016). “” Environ Microbiol, 18(6), 2039-2051. doi:10.1111/1462-2920.1323.

Perisin, M., Vetter, M.,, & Bergelson, J. (2016). “” ISME J, 10(4), 1020-1024. doi:10.1038/ismej.2015.16.

,, McDermott, J., Algar, C.,Meyer, J. L., Sylva, S., Seewald, J., German, C. R., & (2016). “” Environ Microbiol, 18(6), 1970-1987. doi:10.1111/1462-2920.1317.

Rochman, C. M., Browne, M. A., Underwood, A. J., van Franeker, J. A., Hompson, R. C. T., & Amaral-Zettler, L. A.(2016). “” Ecology, 97(2), 302-312. doi:10.1890/14-2070..

Rodriguez, F., & Arkhipova, I. R.(2016). “” Genetics, 203(1), 255-268. doi:10.1534/genetics.116.18673.

Sangwan, N., Xia, F., & (2016). “” Microbiome, 4(1), 8. doi:10.1186/s40168-016-0154-.

Schmidt, V.,Amaral-Zettler, L. A., Davidson, J., Summerfelt, S., & Good, C. (2016). “” Appl Environ Microbiol, 82(15), 4470-4481. doi:10.1128/AEM.00902-1.

Sharma, A.,, & Lal, R. (2016). “” Scientific Reports, 6, 25527. doi:ARTN 25527 10.1038/srep2552.

Sielaff, M., Schmidt, H., Struck, T. H., Rosenkranz, D.,Mark Welch, D. B., Hankeln, T., & Herlyn, H. (2016). “” Rotifera): Mitochondrial gene order verifies epizoic Seisonidea as sister to endoparasitic Acanthocephala within monophyletic Hemirotifera. Mol Phylogenet Evol, 96, 79-92. doi:10.1016/j.ympev.2015.11.01.

Sun, R., Dsouza, M.,, Guo, X., Wang, D., Guo, Z., Ni, Y., & Chu, H. (2016). “” Environ Microbiol, 18(12), 5137-5150. doi:10.1111/1462-2920.1351.

Topcuoglu, B. D., Stewart, L. C.,Morrison, H. G., Butterfield, D. A.,, & Holden, J. F. (2016). “” Frontiers in Microbiology, 7(ARTN 1240). doi:10.3389/fmicb.2016.0124.

Utter, D. R., Welch, J. L. M., & (2016). “” FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 7(ARTN 564). doi:10.3389/fmicb.2016.0056.

Vineis, J. H., Ringus, D. L.,Morrison, H. G., Delmont, T. O., Dalal, S., Raffals, L. H., Antonopoulos, D. A., Rubin, D. T.,, Chang, E. B., & Sogin, M. L.(2016). “” MBio, 7(6), e01713-01716. doi:10.1128/mBio.01713-1.

Walsh, E. A., Kirkpatrick, J. B., Pockalny, R., Sauvage, J., Spivack, A. J., Murray, R. W.,Sogin, M. L., & D’Hondt, S. (2016). “” Appl Environ Microbiol, 82(16), 4994-4999. doi:10.1128/AEM.00809-1.

Walsh, E. A., Kirkpatrick, J. B., Rutherford, S. D., Smith, D. C., Sogin, M., & D’Hondt, S. (2016). “” ISME J, 10(4), 979-989. doi:10.1038/ismej.2015.17.

Walters, W., Hyde, E. R., Berg-Lyons, D., Ackermann, G., Humphrey, G., Parada, A.,, Jansson, J. K., Caporaso, J. G., Fuhrman, J. A., Apprill, A., & Knight, R. (2016). “” mSystems, 1(1). doi:10.1128/mSystems.00009-1.

Ward, M. A., Pierre, J. F., Leal, R. F., Huang, Y., Shogan, B., Dalal, S. R., Weber, C. R., Leone, V. A., Musch, M. W., An, G. C., Rao, M. C., Rubin, D. T., Raffals, L. E., Antonopoulos, D. A.,Sogin, M. L., Hyman, N. H., Alverdy, J. C., & Chang, E. B. (2016). “” Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol, 310(11), G973-988. doi:10.1152/ajpgi.00017.201.

Wardrip, N. C., Dsouza, M., Urgun-Demirtas, M., Snyder, S. W.,, & Arnusch, C. J. (2016). “” ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 8(44), 30271-30280. doi:10.1021/acsami.6b1133.

Yang, T., Weisenhorn, P.,, Ni, Y., Sun, R., Shi, Y., & Chu, H. (2016). “” Environ Microbiol, 18(8), 2455-2469. doi:10.1111/1462-2920.1315.

Zheng, Y., Huang, Y., Andersen, R. A., & Amaral-Zettler, L. A.(2016). “” Geochimica et Cosmochimica Acta, 175, 36-46. doi:10.1016/j.gca.2015.11.02.

Zozaya, M., Ferris, M. J., Siren, J. D., Lillis, R., Myers, L., Nsuami, M. J.,, Brown, J., Taylor, C. M., & Martin, D. H. (2016). “” Microbiome, 4(1), 16. doi:10.1186/s40168-016-0161-.

2015

Alivisatos, A. P., Blaser, M. J., Brodie, E. L., Chun, M., Dangl, J. L., Donohue, T. J., Dorrestein, P. C.,, Green, J. L., Jansson, J. K., Knight, R., Maxon, M. E., McFall-Ngai, M. J., Miller, J. F., Pollard, K. S., Ruby, E. G., & Taha, S. A. (2015). “” Science, 350. doi:10.1126/science.aac848.

Amaral-Zettler, L. A., Zettler, E. R., Slikas, B., Boyd, G. D., Melvin, D. W., Morrall, C. E., Proskurowski, G., & Mincer, T. J. (2015). “” Frontiers in Ecology and the Environment, 13(10), 541-546. doi:10.1890/15001.

Amata, E., Bland, N. D.,Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2015). “” Tetrahedron Lett, 56(21), 2832-2835. doi:10.1016/j.tetlet.2015.04.06.

Anderson, R. E.,Sogin, M. L., & Baross, J. A. (2015). “” FEMS Microbiol Ecol, 91(1), 1-11. doi:10.1093/femsec/fiu01.

Angermeyer, A., Crosby, S. C., & (2015). “” Environ Microbiol, 18(1), 75-86. doi:10.1111/1462-2920.1282.

Bertrand, E. M., McCrow, J. P., Moustafa, A., Zheng, H., McQuaid, J. B., Delmont, T. O.,Post, A. F., Sipler, R. E., Spackeen, J. L., Xu, K., Bronk, D. A., Hutchins, D. A., & Allen, A. E. (2015). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 112(32), 9938-9943. doi:10.1073/pnas.150161511.

Bowen, J. L., Weisman, D., Yasuda, M., Jayakumar, A.,Morrison, H. G., & Ward, B. B. (2015). “” Microb Ecol, 70(2), 311-321. doi:10.1007/s00248-015-0582-.

Browne, M. A., Chapman, M. G., Thompson, R. C.,Amaral-Zettler, L. A., Jambeck, J., & Mallos, N. J. (2015). “” Environ Sci Technol, 49(12), 7082-7094. doi:10.1021/es506057.

Burgsdorf, I., Slaby, B. M., Handley, K. M., Haber, M., Blom, J., Marshall, C. W.,, Hentschel, U., & Steindler, L. (2015). “” MBio, 6(3), e00391-00315. doi:10.1128/mBio.00391-1.

Chafee, M.,Maignien, L., & Simmons, S. L.(2015). “” Environ Microbiol, 17(7), 2239-2253. doi:10.1111/1462-2920.1266.

Delmont, T. O.,, Maccario, L., Prestat, E., Esen, O. C., Pelletier, E., Le Paslier, D., Simonet, P., & Vogel, T. M. (2015). “” Front Microbiol, 6, 358. doi:10.3389/fmicb.2015.0035.

Delmont, T. O.,,Vineis, J. H., & Post, A. F.(2015). “” Front Microbiol, 6, 1090. doi:10.3389/fmicb.2015.0109.

Ducklow, H. W., Wilson, S. E.,Post, A. F., Stammerjohn, S. E., Erickson, M., Lee, S., Lowry, K. E., Sherrell, R. M., & Yager, P. L. (2015). “” Elementa: Science of the Anthropocene, 3(46), 000046. doi:10.12952/journal.elementa.00004.

, Esen, O. C., Quince, C.,Vineis, J. H.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., & Delmont, T. O. (2015). “” PeerJ, 3, e1319. doi:10.7717/peerj.131.

,Morrison, H. G., Lescault, P. J.,,Vineis, J. H., & Sogin, M. L.(2015). “” ISME J, 9(4), 968-979. doi:10.1038/ismej.2014.19.

,Sogin, M. L.,Morrison, H. G.,Vineis, J. H., Fisher, J. C., Newton, R. J., & McLellan, S. L. (2015). “” ISME J, 9(1), 90-100. doi:10.1038/ismej.2014.9.

Filkins, L. M., Dolben, E. L., Willger, S. D., Gifford, A. H.,Sogin, M. L.,Morrison, H. G.,Grim, S. L., Ashare, A., Schwartzman, J. D., & Hogan, D. (2015). “Bacfun: An Rna-Based Diagnostic for Cystic Fibrosis Respiratory Samples.” Pediatric Pulmonology, 50, 321-321.

Fisher, J. C.,, Green, H. C., Shanks, O. C.,Morrison, H. G.,Vineis, J. H.,Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2015). “” Appl Environ Microbiol, 81(20), 7023-7033. doi:10.1128/AEM.01524-1.

, & Crump, B. C. (2015). “” PLoS One, 10(11), e0140578. doi:10.1371/journal.pone.014057.

Fuller, M., Priyadarshini, M., Gibbons, S. M., Angueira, A. R., Brodsky, M., Hayes, M. G., Kovatcheva-Datchary, P., Backhed, F.,, Lowe, W. L. Jr., & Layden, B. T. (2015). “” Am J Physiol Endocrinol Metab, 309(10), E840-851. doi:10.1152/ajpendo.00171.201.

Gibbons, S. M., & (2015). “” Curr Opin Genet Dev, 35, 66-72. doi:10.1016/j.gde.2015.10.00.

Gibbons, S. M., Schwartz, T., Fouquier, J., Mitchell, M., Sangwan, N.,, & Kelley, S. T. (2015). “” Appl Environ Microbiol, 81(2), 765-773. doi:10.1128/AEM.03117-1.

, & Henry, C. (2015). “” Environ Microbiol Rep, 7(1), 20-22. doi:10.1111/1758-2229.1225.

Gordon, J., Gandhi, P., Shekhawat, G., Frazier, A., Hampton-Marcell, J., & (2015). “” Microbiome, 3(1), 79. doi:10.1186/s40168-015-0141-.

Green, H. C., Fisher, J. C., McLellan, S. L.,Sogin, M. L., & Shanks, O. C. (2015). “” Appl Environ Microbiol, 82(5), 1496-1503. doi:10.1128/AEM.02456-1.

Hoen, A. G., Li, J., Moulton, L. A., O’Toole, G. A., Housman, M. L., Koestler, D. C., Guill, M. F., Moore, J. H., Hibberd, P. L.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Karagas, M. R., & Madan, J. C. (2015). “” J Pediatr, 167(1), 138-147 e131-133. doi:10.1016/j.jpeds.2015.02.04.

Huang, E. Y., Inoue, T., Leone, V. A., Dalal, S., Touw, K., Wang, Y., Musch, M. W., Theriault, B., Higuchi, K., Donovan, S.,, & Chang, E. B. (2015). “” Inflamm Bowel Dis, 21(5), 963-972. doi:10.1097/MIB.000000000000033.

(2015). “” Making methane down deep. Science, 349(6246), 376-377. doi:10.1126/science.aac667.

Hunter-Cevera, K. R.,Post, A. F., Peacock, E. E., & Sosik, H. M. (2015). “” Microb Ecol, 71(2), 276-289. doi:10.1007/s00248-015-0644-.

Huo, Y. Y., Cheng, H.,Post, A. F., Wang, C. S., Jiang, X. W., Pan, J., Wu, M., & Xu, X. W. (2015). “” Acta Oceanologica Sinica, 34(4), 92-113. doi:10.1007/s13131-015-0650-.

Kleindienst, S., Seidel, M., Ziervogel, K., Grim, S., Loftis, K., Harrison, S., Malkin, S. Y., Perkins, M. J., Field, J.,Sogin, M. L., Dittmar, T., Passow, U., Medeiros, P. M., & Joye, S. B. (2015). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 112(48), 14900-14905. doi:10.1073/pnas.150738011.

Kopf, A., Bicak, M., Kottmann, R., Schnetzer, J., Kostadinov, I., Lehmann, K., Fernandez-Guerra, A., Jeanthon, C., Rahav, E., Ullrich, M., Wichels, A., Gerdts, G., Polymenakou, P., Kotoulas, G., Siam, R., Abdallah, R. Z., Sonnenschein, E. C., Cariou, T., O’Gara, F., Jackson, S., Orlic, S., Steinke, M., Busch, J., Duarte, B., Cacador, I., Canning-Clode, J., Bobrova, O., Marteinsson, V., Reynisson, E., Loureiro, C. M., Luna, G. M., Quero, G. M., Loscher, C. R., Kremp, A., DeLorenzo, M. E., Ovreas, L., Tolman, J., LaRoche, J., Penna, A., Frischer, M., Davis, T., Katherine, B., Meyer, C. P., Ramos, S., Magalhaes, C., Jude-Lemeilleur, F., Aguirre-Macedo, M. L., Wang, S., Poulton, N., Jones, S., Collin, R., Fuhrman, J. A., Conan, P., Alonso, C., Stambler, N., Goodwin, K., Yakimov, M. M., Baltar, F., Bodrossy, L., Van De Kamp, J., Frampton, D. M., Ostrowski, M., Van Ruth, P., Malthouse, P., Claus, S., Deneudt, K., Mortelmans, J., Pitois, S., Wallom, D., Salter, I., Costa, R., Schroeder, D. C., Kandil, M. M., Amaral, V., Biancalana, F., Santana, R., Pedrotti, M. L., Yoshida, T., Ogata, H., Ingleton, T., Munnik, K., Rodriguez-Ezpeleta, N., Berteaux-Lecellier, V., Wecker, P., Cancio, I., Vaulot, D., Bienhold, C., Ghazal, H., Chaouni, B., Essayeh, S., Ettamimi, S., Zaid el, H., Boukhatem, N., Bouali, A., Chahboune, R., Barrijal, S., Timinouni, M., El Otmani, F., Bennani, M., Mea, M., Todorova, N., Karamfilov, V., Ten Hoopen, P., Cochrane, G., L’Haridon, S., Bizsel, K. C., Vezzi, A., Lauro, F. M., Martin, P., Jensen, R. M., Hinks, J., Gebbels, S., Rosselli, R., De Pascale, F., Schiavon, R., Dos Santos, A., Villar, E., Pesant, S., Cataletto, B., Malfatti, F., Edirisinghe, R., Silveira, J. A., Barbier, M., Turk, V., Tinta, T., Fuller, W. J., Salihoglu, I., Serakinci, N., Ergoren, M. C., Bresnan, E., Iriberri, J., Nyhus, P. A., Bente, E., Karlsen, H. E., Golyshin, P. N., Gasol, J. M., Moncheva, S., Dzhembekova, N., Johnson, Z., Sinigalliano, C. D., Gidley, M. L., Zingone, A., Danovaro, R., Tsiamis, G., Clark, M. S., Costa, A. C., El Bour, M., Martins, A. M., Collins, R. E., Ducluzeau, A. L., Martinez, J., Costello, M. J.,Amaral-Zettler, L. A.,, Davies, N., Field, D., & Glockner, F. O. (2015). “” Gigascience, 4, 27. doi:10.1186/s13742-015-0066-.

Larsen, P. E., Scott, N.,Post, A. F., Field, D., Knight, R., Hamada, Y., & (2015). “” ISME J, 9(1), 166-179. doi:10.1038/ismej.2014.10.

Lax, S., & (2015). “” Trends Mol Med, 21(7), 427-432. doi:10.1016/j.molmed.2015.03.00.

Lax, S., Hampton-Marcell, J. T., Gibbons, S. M., Colares, G. B., Smith, D., Eisen, J. A., & (2015). “” Microbiome, 3, 21. doi:10.1186/s40168-015-0082-.

Lax, S., Nagler, C. R., & (2015). “” Trends Immunol, 36(3), 121-123. doi:10.1016/j.it.2015.01.00.

Liebeskind, B. J., Hillis, D. M., & Zakon, H. H. (2015). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 112(8), E846-851. doi:10.1073/pnas.150119511.

Lin, X., Handley, K. M.,, & Kostka, J. E. (2015). “” ISME J, 9(12), 2740-2744. doi:10.1038/ismej.2015.7.

Lüchmann, K. H., Clark, M. S., Bainy, A. C.,, Craft, J. A., Chipman, J. K., Thorne, M. A., Mattos, J. J., Siebert, M. N., & Schroeder, D. C. (2015). “” Aquat Toxicol, 166, 10-20. doi:10.1016/j.aquatox.2015.06.01.

Mackey, K. R. M., Chien, C. T.,Post, A. F., Saito, M. A., & Paytan, A. (2015). “” Front Microbiol, 5, 794. doi:10.3389/fmicb.2014.0079.

Mackey, K. R. M.,Post, A. F., McIlvin, M. R., Cutter, G. A., John, S. G., & Saito, M. A. (2015). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 112(32), 9944-9949. doi:10.1073/pnas.150944811.

Moran, Y., Barzilai, M. G., Liebeskind, B. J., & Zakon, H. H. (2015). “” J Exp Biol, 218(Pt 4), 515-525. doi:10.1242/jeb.11027.

Newton, R. J., McLellan, S. L., Dila, D. K.,Vineis, J. H.,Morrison, H. G.,, & Sogin, M. L.(2015). “” MBio, 6(2), e02574. doi:10.1128/mBio.02574-1.

Ochiana, S. O., Bland, N. D., Settimo, L.,Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2015). “” Evaluation of analogs of the human PDE4 inhibitor GSK-256066 as inhibitors of PDEB1 of Trypanosoma brucei. Chem Biol Drug Des, 85(5), 549-564. doi:10.1111/cbdd.1244.

Quince, C., Ijaz, U. Z., Loman, N.,, Saulnier, D., Russell, J., Haig, S. J., Calus, S. T., Quick, J., Barclay, A., Bertz, M., Blaut, M., Hansen, R., McGrogan, P., Russell, R. K., Edwards, C. A., & Gerasimidis, K. (2015). “” Am J Gastroenterol, 110(12), 1718-1729. doi:10.1038/ajg.2015.35.

Saito, M. A., Dorsk, A.,Post, A. F., McIlvin, M. R., Rappe, M. S., DiTullio, G. R., & Moran, D. M. (2015). “” Proteomics, 15(20), 3521-3531. doi:10.1002/pmic.20140063.

Satinsky, B. M.,, Doherty, M., Smith, C. B., Sharma, S., Ward, N. D., Krusche, A. V., Yager, P. L., Richey, J. E., Moran, M. A., & Crump, B. C. (2015). “” Microbiome, 3(1), 39. doi:10.1186/s40168-015-0099-.

Schmidt, V. T., Smith, K. F., Melvin, D. W., & Amaral-Zettler, L. A.(2015). “” Mol Ecol, 24(10), 2537-2550. doi:10.1111/mec.1317.

Shade, A., & (2015). “” Trends Microbiol, 23(6), 335-340. doi:10.1016/j.tim.2015.01.00.

Sielaff, M., Schmidt, H., Struck, T. H., Rosenkranz, D.,Mark Welch, D. B., Hankeln, T., & Herlyn, H. (2015). “” Rotifera): Mitochondrial gene order verifies epizoic Seisonidea as sister to endoparasitic Acanthocephala within monophyletic Hemirotifera. Mol Phylogenet Evol, 96, 79-92. doi:10.1016/j.ympev.2015.11.01.

Signorovitch, A., Hur, J., Gladyshev, E., & (2015). “” Genetics, 200(2), 581-590. doi:10.1534/genetics.115.17671.

Snell, T. W., Johnston, R. K.,Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B.(2015). “” Invertebr Reprod Dev, 59(1), 5-10. doi:10.1080/07924259.2014.92551.

Traeger, L. L., Volkening, J. D., Moffett, H., Gallant, J. R., Chen, P. H., Novina, C. D., Phillips, G. N. Jr., Anand, R., Wells, G. B., Pinch, M., Guth, R., Unguez, G. A., Albert, J. S., Zakon, H., Sussman, M. R., & Samanta, M. P. (2015). “” BMC Genomics, 16, 243. doi:10.1186/s12864-015-1288-.

Van Bonn, W., LaPointe, A., Gibbons, S. M., Frazier, A., Hampton-Marcell, J., & (2015). “” Zoo Biol, 34(4), 360-367. doi:10.1002/zoo.2122.

Walsh, E. A., Smith, D. C.,Sogin, M. L., & D’Hondt, S. (2015). “” Aquatic Microbial Ecology, 75(1), 1-13. doi:10.3354/ame0174.

Wood, M., Gibbons, S. M., Lax, S., Eshoo-Anton, T. W., Owens, S. M., Kennedy, S.,, & Hampton-Marcell, J. T. (2015). “” Microbiome, 3, 25. doi:10.1186/s40168-015-0088-.

Ying, S., Zeng, D. N., Chi, L., Tan, Y., Galzote, C., Cardona, C., Lax, S., Gilbert, J., & Quan, Z. X. (2015). “” PLoS One, 10(10), e0141842. doi:10.1371/journal.pone.014184.

Zarraonaindia, I., Owens, S. M., Weisenhorn, P., West, K., Hampton-Marcell, J., Lax, S., Bokulich, N. A., Mills, D. A., Martin, G., Taghavi, S., van der Lelie, D., & (2015). “” MBio, 6(2). doi:10.1128/mBio.02527-1.

2014

Amata, E., Bland, N. D., Hoyt, C. T., Settimo, L.,Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2014). “” Bioorg Med Chem Lett, 24(17), 4084-4089. doi:10.1016/j.bmcl.2014.07.06.

Anderson, R. E.,Sogin, M. L., & Baross, J. A. (2014). “” PLoS One, 9(10), e109696. doi:10.1371/journal.pone.010969.

Apprill, A., Robbins, J.,, Pack, A. A.,, Mattila, D., Moore, M., Niemeyer, M., Moore, K. M., & Mincer, T. J. (2014). “” PLoS One, 9(3), e90785. doi:10.1371/journal.pone.009078.

Beliaev, A. S., Romine, M. F.,, Bernstein, H. C., Linggi, B. E., Markillie, L. M., Isern, N. G., Chrisler, W. B., Kucek, L. A., Hill, E. A., Pinchuk, G. E., Bryant, D. A., Wiley, H. S., Fredrickson, J. K., & Konopka, A. (2014). “” ISME J, 8(11), 2243-2255. doi:10.1038/ismej.2014.6.

Bullerjahn, G. S., & Post, A. F.(2014). “” Front Microbiol, 5, 359. doi:10.3389/fmicb.2014.0035.

Celaj, S., Gleeson, M. W., Deng, J., O’Toole, G. A., Hampton, T. H., Toft, M. F.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Putra, J., Suriawinata, A. A., & Gorham, J. D. (2014). “” Lab Invest, 94(9), 938-949. doi:10.1038/labinvest.2014.9.

Cusack, D. F., Axsen, J., Shwom, R., Hartzell-Nichols, L., White, S., & Mackey, K. R. M. (2014). “” Frontiers in Ecology and the Environment, 12(5), 280-287. doi:10.1890/13003.

Davies, N., Field, D.,Amaral-Zettler, L. A., Bicak, M., Bourlat, S., Coddington, J., Deck, J., Drummond, A.,, Glöckner, F. O., Kottmann, R., Meyer, C., Morrison, N., Obst, M., Robbins, R., Schriml, L., Sterk, P., & Stones-Havas, S. (2014). “” Standards in Genomic Sciences; Vol 9, No 3 (2014): Standards in Genomic Sciences.

Davies, N., Field, D.,Amaral-Zettler, L. A., Clark, M. S., Deck, J., Drummond, A., Faith, D. P., Geller, J., Gilbert, J., Glockner, F. O., Hirsch, P. R., Leong, J. A., Meyer, C., Obst, M., Planes, S., Scholin, C., Vogler, A. P., Gates, R. D., Toonen, R., Berteaux-Lecellier, V., Barbier, M., Barker, K., Bertilsson, S., Bicak, M., Bietz, M. J., Bobe, J., Bodrossy, L., Borja, A., Coddington, J., Fuhrman, J., Gerdts, G., Gillespie, R., Goodwin, K., Hanson, P. C., Hero, J. M., Hoekman, D., Jansson, J., Jeanthon, C., Kao, R., Klindworth, A., Knight, R., Kottmann, R., Koo, M. S., Kotoulas, G., Lowe, A. J., Marteinsson, V. T., Meyer, F., Morrison, N., Myrold, D. D., Pafilis, E., Parker, S., Parnell, J. J., Polymenakou, P. N., Ratnasingham, S., Roderick, G. K., Rodriguez-Ezpeleta, N., Schonrogge, K., Simon, N., Valette-Silver, N. J., Springer, Y. P., Stone, G. N., Stones-Havas, S., Sansone, S. A., Thibault, K. M., Wecker, P., Wichels, A., Wooley, J. C., Yahara, T., Zingone, A., & COS, G. O. (2014). “” Gigascience, 3(1), 2. doi:10.1186/2047-217X-3-.

Dejea, C. M., Wick, E. C., Hechenbleikner, E. M., White, J. R.,Mark Welch, J. L., Rossetti, B. J., Peterson, S. N., Snesrud, E. C.,, Lazarev, M., Stein, E., Vadivelu, J., Roslani, A. C., Malik, A. A., Wanyiri, J. W., Goh, K. L., Thevambiga, I., Fu, K., Wan, F., Llosa, N., Housseau, F., Romans, K., Wu, X., McAllister, F. M., Wu, S., Vogelstein, B., Kinzler, K. W., Pardoll, D. M., & Sears, C. L. (2014). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 111(51), 18321-18326. doi:10.1073/pnas.140619911.

Delmont, T. O., Francioli, D., Jacquesson, S., Laoudi, S., Mathieu, A., Nesme, J., Ceccherini, M. T., Nannipieri, P., Simonet, P., & Vogel, T. M. (2014). “” Biology and Fertility of Soils, 50(7), 1069-1076. doi:10.1007/s00374-014-0925-.

Delmont, T. O., Hammar, K. M., Ducklow, H. W., Yager, P. L., & Post, A. F.(2014). “” Front Microbiol, 5, 646. doi:10.3389/fmicb.2014.0064.

Durham, B. P., Grote, J., Whittaker, K. A., Bender, S. J., Luo, H.,Grim, S. L., Brown, J. M., Casey, J. R., Dron, A., Florez-Leiva, L., Krupke, A., Luria, C. M., Mine, A. H., Nigro, O. D., Pather, S., Talarmin, A., Wear, E. K., Weber, T. S., Wilson, J. M., Church, M. J., DeLong, E. F., Karl, D. M., Steward, G. F., Eppley, J. M., Kyrpides, N. C., Schuster, S., & Rappe, M. S. (2014). “” Stand Genomic Sci, 9(3), 632-645. doi:10.4056/sigs.499898.

,,Huse, S. M., & Mark Welch, J. L.(2014). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 111(28), E2875-2884. doi:10.1073/pnas.140964411.

,Morrison, H. G.,Huse, S. M., & Sogin, M. L.(2014). “” Brief Bioinform, 15(5), 783-787. doi:10.1093/bib/bbt01.

Ferreira, A. J., Siam, R., Setubal, J. C., Moustafa, A., Sayed, A., Chambergo, F. S., Dawe, A. S., Ghazy, M. A., Sharaf, H., Ouf, A., Alam, I., Abdel-Haleem, A. M., Lehvaslaiho, H., Ramadan, E., Antunes, A., Stingl, U., Archer, J. A., Jankovic, B. R.,Sogin, M. L., Bajic, V. B., & El-Dorry, H. (2014). “” PLoS One, 9(6), e97338. doi:10.1371/journal.pone.009733.

Field, D., Sterk, P., Kottmann, R., De Smet, J. W.,Amaral-Zettler, L. A., Cochrane, G., Cole, J. R., Davies, N., Dawyndt, P., Garrity, G. M.,, Glockner, F. O., Hirschman, L., Klenk, H. P., Knight, R., Kyrpides, N., Meyer, F., Karsch-Mizrachi, I., Morrison, N., Robbins, R., San Gil, I., Sansone, S., Schriml, L., Tatusova, T., Ussery, D., Yilmaz, P., White, O., Wooley, J., & Caporaso, G. (2014). “” Stand Genomic Sci, 9(3), 599-601. doi:10.4056/sigs.555968.

Fischer, A. H., Mozzherin, D.,, Lans, K. D., Wilson, N., Cosentino, C., & (2014). “” Integr Comp Biol, 54(2), 250-263. doi:10.1093/icb/icu06.

Gallant, J. R., Traeger, L. L., Volkening, J. D., Moffett, H., Chen, P. H., Novina, C. D., Phillips, G. N. Jr., Anand, R., Wells, G. B., Pinch, M., Guth, R., Unguez, G. A., Albert, J. S., Zakon, H. H., Samanta, M. P., & Sussman, M. R. (2014). “” Genomic basis for the convergent evolution of electric organs. Science, 344(6191), 1522-1525. doi:10.1126/science.125443.

Ghezzi, A., Liebeskind, B. J., Thompson, A., Atkinson, N. S., & Zakon, H. H. (2014). “” Front Mol Neurosci, 7, 15. doi:10.3389/fnmol.2014.0001.

Gifford, A. H., Alexandru, D. M., Li, Z., Dorman, D. B., Moulton, L. A., Price, K. E., Hampton, T. H.,Sogin, M. L., Zuckerman, J. B., Parker, H. W., Stanton, B. A., & O’Toole, G. A. (2014). “” J Cyst Fibros, 13(3), 311-318. doi:10.1016/j.jcf.2013.11.00.

, Dick, G. J., Jenkins, B., Heidelberg, J., Allen, E., Mackey, K. R., & DeLong, E. F. (2014). “” Stand Genomic Sci, 9(3), 1252-1258. doi:10.4056/sigs.574994.

, Jansson, J. K., & Knight, R. (2014). “” BMC Biol, 12. doi:10.1186/s12915-014-0069-.

, & Neufeld, J. D. (2014). “” PLoS Biol, 12(12), e1002020. doi:10.1371/journal.pbio.100202.

Glass, E. M., Dribinsky, Y., Yilmaz, P., Levin, H., Van Pelt, R., Wendel, D., Wilke, A., Eisen, J. A.,Huse, S. M., Shipanova, A.,Sogin, M. L., Stajich, J., Knight, R., Meyer, F., & Schriml, L. M. (2014). “” ISME J, 8(1), 1-3. doi:10.1038/ismej.2013.17.

Gribble, K. E., Jarvis, G., Bock, M., & Mark Welch, D. B.(2014). “” Aging Cell, 13(4), 623-630. doi:10.1111/acel.1221.

Gribble, K. E., Kaido, O., Jarvis, G., & Mark Welch, D. B.(2014). “” Exp Gerontol, 51, 28-37. doi:10.1016/j.exger.2013.12.00.

Halliday, E., McLellan, S. L.,Amaral-Zettler, L. A.,Sogin, M. L., & Gast, R. J. (2014). “” PLoS One, 9(3), e90815. doi:10.1371/journal.pone.009081.

Hampton, T. H., Green, D. M., Cutting, G. R.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Gifford, A. H., Stanton, B. A., & O’Toole, G. A. (2014). “” Microbiome, 2, 14. doi:10.1186/2049-2618-2-1.

Huo, Y. Y., Li, Z. Y., You, H., Wang, C. S.,Post, A. F., Oren, A., & Xu, X. W. (2014). “” nov. and Oceanicola flagellatus sp. nov., moderately halophilic bacteria isolated from seawater. Int J Syst Evol Microbiol, 64(Pt 9), 2975-2979. doi:10.1099/ijs.0.062588-.

Huse, S. M.,Mark Welch, D. B.,Voorhis, A.,Shipunova, A.,Morrison, H. G.,, & Sogin, M. L.(2014). “” BMC Bioinformatics, 15(1), 41. doi:10.1186/1471-2105-15-4.

Huse, S. M., Young, V. B.,Morrison, H. G., Antonopoulos, D. A., Kwon, J., Dalal, S., Arrieta, R., Hubert, N. A., Shen, L.,Vineis, J. H., Koval, J. C.,Sogin, M. L., Chang, E. B., & Raffals, L. E. (2014). “” Microbiome, 2(1), 5. doi:10.1186/2049-2618-2-.

Keeling, P. J., Burki, F., Wilcox, H. M., Allam, B., Allen, E. E.,Amaral-Zettler, L. A., Armbrust, E. V., Archibald, J. M., Bharti, A. K., Bell, C. J., Beszteri, B., Bidle, K. D., Cameron, C. T., Campbell, L., Caron, D. A., Cattolico, R. A., Collier, J. L., Coyne, K., Davy, S. K., Deschamps, P., Dyhrman, S. T., Edvardsen, B., Gates, R. D., Gobler, C. J., Greenwood, S. J., Guida, S. M., Jacobi, J. L., Jakobsen, K. S., James, E. R., Jenkins, B., John, U., Johnson, M. D., Juhl, A. R., Kamp, A., Katz, L. A., Kiene, R., Kudryavtsev, A., Leander, B. S., Lin, S., Lovejoy, C., Lynn, D., Marchetti, A., McManus, G., Nedelcu, A. M., Menden-Deuer, S., Miceli, C., Mock, T., Montresor, M., Moran, M. A., Murray, S., Nadathur, G., Nagai, S., Ngam, P. B., Palenik, B., Pawlowski, J., Petroni, G., Piganeau, G., Posewitz, M. C., Rengefors, K., Romano, G., Rumpho, M. E., Rynearson, T., Schilling, K. B., Schroeder, D. C., Simpson, A. G., Slamovits, C. H., Smith, D. R., Smith, G. J., Smith, S. R., Sosik, H. M., Stief, P., Theriot, E., Twary, S. N., Umale, P. E., Vaulot, D., Wawrik, B., Wheeler, G. L., Wilson, W. H., Xu, Y., Zingone, A., & Worden, A. Z. (2014). “” PLoS Biol, 12(6), e1001889. doi:10.1371/journal.pbio.100188.

Koskey, A. M., Fisher, J. C.,, Ponce-Terashima, R., Reis, M. G., Blanton, R. E., & McLellan, S. L. (2014). “” Environ Microbiol Rep, 6(6), 696-704. doi:10.1111/1758-2229.1218.

Kyrpides, N. C., Hugenholtz, P., Eisen, J. A., Woyke, T., Goker, M., Parker, C. T., Amann, R., Beck, B. J., Chain, P. S., Chun, J., Colwell, R. R., Danchin, A., Dawyndt, P., Dedeurwaerdere, T., DeLong, E. F., Detter, J. C., De Vos, P., Donohue, T. J., Dong, X. Z., Ehrlich, D. S., Fraser, C., Gibbs, R.,, Gilna, P., Glockner, F. O., Jansson, J. K., Keasling, J. D., Knight, R., Labeda, D., Lapidus, A., Lee, J. S., Li, W. J., Ma, J., Markowitz, V., Moore, E. R., Morrison, M., Meyer, F., Nelson, K. E., Ohkuma, M., Ouzounis, C. A., Pace, N., Parkhill, J., Qin, N., Rossello-Mora, R., Sikorski, J., Smith, D.,Sogin, M. L., Stevens, R., Stingl, U., Suzuki, K., Taylor, D., Tiedje, J. M., Tindall, B., Wagner, M., Weinstock, G., Weissenbach, J., White, O., Wang, J., Zhang, L., Zhou, Y. G., Field, D., Whitman, W. B., Garrity, G. M., & Klenk, H. P. (2014). “” PLoS Biol, 12(8), e1001920. doi:10.1371/journal.pbio.100192.

LaBelle, E. V., Marshall, C. W.,, & May, H. D. (2014). “” PLoS One, 9(10), e109935. doi:10.1371/journal.pone.010993.

Lau, M. C., Cameron, C., Magnabosco, C., Brown, C. T., Schilkey, F., Grim, S., Hendrickson, S., Pullin, M., Sherwood Lollar, B., van Heerden, E., Kieft, T. L., & Onstott, T. C. (2014). “” Front Microbiol, 5, 531. doi:10.3389/fmicb.2014.0053.

Lie, A. A., Liu, Z., Hu, S. K., Jones, A. C., Kim, D. Y., Countway, P. D.,Amaral-Zettler, L. A., Cary, S. C., Sherr, E. B., Sherr, B. F., Gast, R. J., & Caron, D. A. (2014). “” Appl Environ Microbiol, 80(14), 4363-4373. doi:10.1128/AEM.00057-1.

Luria, C. M., Ducklow, H. W., & Amaral-Zettler, L. A.(2014). “” Aquatic Microbial Ecology, 73(2), 107-121. doi:10.3354/ame0170.

Maignien, L.,DeForce, E. A.,Chafee, M. E.,, & Simmons, S. L.(2014). “” MBio, 5(1), e00682-00613. doi:10.1128/mBio.00682-1.

Maltz, M. A., Bomar, L., Lapierre, P.,Morrison, H. G., McClure, E. A.,Sogin, M. L., & Graf, J. (2014). “” Front Microbiol, 5, 151. doi:10.3389/fmicb.2014.0015.

Mark Welch, J. L., Utter, D. R., Rossetti, B. J.,Mark Welch, D. B.,, & (2014). “” Front Microbiol, 5, 568. doi:10.3389/fmicb.2014.0056.

Markham, M. R., & Zakon, H. H. (2014). “” J Neurosci, 34(19), 6668-6678. doi:10.1523/JNEUROSCI.0615-14.201.

McLellan, S. L., & (2014). “” Trends Microbiol, 22(12), 697-706. doi:10.1016/j.tim.2014.08.00.

Meyer, J. L., & (2014). “” ISME J, 8(4), 867-880. doi:10.1038/ismej.2013.20.

Moran, Y., & Zakon, H. H. (2014). “” Genome Biol Evol, 6(9), 2210-2217. doi:10.1093/gbe/evu17.

Nelson, M. C.,Morrison, H. G., Benjamino, J.,Grim, S. L., & Graf, J. (2014). “” PLoS One, 9(4), e94249. doi:10.1371/journal.pone.009424.

Ong, W. K., Vu, T. T., Lovendahl, K. N., Llull, J. M.,, Romine, M. F., & Reed, J. L. (2014). “” BMC Syst Biol, 8(1), 31. doi:10.1186/1752-0509-8-3.

Orcutt, B. N., LaRowe, D. E., Lloyd, K. G., Mills, H., Orsi, W., Reese, B. K., Sauvage, J.,, & Amend, J. (2014). “” Scientific Drilling, 17, 61-66. doi:10.5194/sd-17-61-201.

Reed, D. C.,,, & Dick, G. J. (2014). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 111(5), 1879-1884. doi:10.1073/pnas.131371311.

,Maignien, L., Murat Eren, A.,, Apprill, A.,Sogin, M. L., & Vanreusel, A. (2014). “” ISME J, 8(6), 1198-1209. doi:10.1038/ismej.2013.22.

Reznikoff, W. S.(2014). “” Res Microbiol, 165(5), 357-358. doi:10.1016/j.resmic.2014.05.02.

Sadler, N. C., Melnicki, M. R.,, Merkley, E. D., Chrisler, W. B., Hill, E. A., Romine, M. F., Kim, S., Zink, E. M., Datta, S., Smith, R. D., Beliaev, A. S., Konopka, A., & Wright, A. T. (2014). “” ACS Chem Biol, 9(1), 291-300. doi:10.1021/cb400769.

Saito, M. A., McIlvin, M. R., Moran, D. M., Goepfert, T. J., DiTullio, G. R.,Post, A. F., & Lamborg, C. H. (2014). “” Science, 345(6201), 1173-1177. doi:10.1126/science.125645.

Schmidt, V. T.,, Zettler, E., Mincer, T. J., Murphy, L., & Amaral-Zettler, L. A.(2014). “” Front Microbiol, 5, 563. doi:10.3389/fmicb.2014.0056.

Scientists, G. C. o., Bracken-Grissom, H., Collins, A. G., Collins, T., Crandall, K., Distel, D., Dunn, C., Giribet, G., Haddock, S., Knowlton, N., Martindale, M., Medina, M., Messing, C., O’Brien, S. J., Paulay, G., Putnam, N., Ravasi, T., Rouse, G. W., Ryan, J. F., Schulze, A., Worheide, G., Adamska, M., Bailly, X., Breinholt, J., Browne, W. E., Diaz, M. C., Evans, N., Flot, J. F., Fogarty, N., Johnston, M., Kamel, B., Kawahara, A. Y., Laberge, T., Lavrov, D., Michonneau, F., Moroz, L. L., Oakley, T., Osborne, K., Pomponi, S. A., Rhodes, A., Santos, S. R., Satoh, N., Thacker, R. W., Van de Peer, Y., Voolstra, C. R.,Mark Welch, D. B., Winston, J., & Zhou, X. (2014). “” J Hered, 105(1), 1-18. doi:10.1093/jhered/est08.

Shafquat, A., Joice, R.,Simmons, S. L., & Huttenhower, C. (2014). “” Trends Microbiol, 22(5), 261-266. doi:10.1016/j.tim.2014.01.01.

Shilova, I. N., Robidart, J. C., James Tripp, H., Turk-Kubo, K., Wawrik, B.,Post, A. F., Thompson, A. W., Ward, B., Hollibaugh, J. T., Millard, A., Ostrowski, M., Scanlan, D. J., Paerl, R. W., Stuart, R., & Zehr, J. P. (2014). “” ISME J, 8(7), 1476-1491. doi:10.1038/ismej.2014..

, & Cosentino, C. (2014). “” Paper presented at the Integrative and Comparative Biology, Austin, TX.

Swan, B. K., Chaffin, M. D., Martinez-Garcia, M.,Morrison, H. G., Field, E. K., Poulton, N. J., Masland, E. D., Harris, C. C., Sczyrba, A., Chain, P. S., Koren, S., Woyke, T., & Stepanauskas, R. (2014). “” PLoS One, 9(4), e95380. doi:10.1371/journal.pone.009538.

Thompson, A., Vo, D., Comfort, C., & Zakon, H. H. (2014). “” Mol Biol Evol, 31(8), 1941-1955. doi:10.1093/molbev/msu14.

Vallino, J., Algar, C., González, N., & Huber, J. (2014). “” In R. C. Dewar, C. H. Lineweaver, R. K. Niven, & K. Regenauer-Lieb (Ed.), Beyond the Second Law (pp. 337-359): Springer Berlin Heidelberg.

Vick-Majors, T. J., Priscu, J. C., & Amaral-Zettler, L. A.(2014). “” ISME J, 8(4), 778-789. doi:10.1038/ismej.2013.19.

Wey-Fabrizius, A. R., Herlyn, H., Rieger, B., Rosenkranz, D., Witek, A.,Mark Welch, D. B., Ebersberger, I., & Hankeln, T. (2014). “” PLoS One, 9(2), e88618. doi:10.1371/journal.pone.008861.

Wickham, S. A., Claessens, M., & Post, A. F.(2014). “” Journal of Plankton Research, 37(1), 258-271. doi:10.1093/plankt/fbu10.

Willger, S. D.,Grim, S. L., Dolben, E. L.,Shipunova, A., Hampton, T. H.,Morrison, H. G., Filkins, L. M., O’Toole, G. A., Moulton, L. A., Ashare, A.,Sogin, M. L., & Hogan, D. A. (2014). “” Microbiome, 2, 40. doi:10.1186/2049-2618-2-4.

Xu, Y., Vick-Majors, T. J., Morgan-Kiss, R., Priscu, J. C., & Amaral-Zettler, L. A.(2014). “” Biol Bull, 227(2), 175-190.

Zakon, H. (2014). “” Brain Behav Evol, 83(4), 245-246. doi:10.1159/00036103.

2013

Akerman, N. H., Butterfield, D. A., & (2013). “” Front Microbiol, 4, 185. doi:10.3389/fmicb.2013.0018.

Alliegro, M. C., & Alliegro, M. A. (2013). “” RNA Biol, 10(3), 391-396. doi:10.4161/rna.2354.

Amend, A. S., Oliver, T. A.,Amaral-Zettler, L. A., Boetius, A., Fuhrman, J. A., Horner-Devine, M. C.,Huse, S. M., Welch, D. B. M., Martiny, A. C., Ramette, A., Zinger, L.,Sogin, M. L., & Martiny, J. B. H. (2013). “” Journal of Biogeography, 40(4), 800-811. doi:10.1111/jbi.1203.

Arkhipova, I. R., & Rodriguez, F.(2013). “” Cytogenet Genome Res, 140(2-4), 295-311. doi:10.1159/00035206.

Arkhipova, I. R.,Yushenova, I. A., & Rodriguez, F.(2013). “” Mob DNA, 4(1), 19. doi:10.1186/1759-8753-4-1.

Bennett, S. A., Coleman, M.,,, Kinsey, J. C., McIntyre, C., Seewald, J. S., & German, C. R. (2013). “” Geochemistry Geophysics Geosystems, 14(2), 317-327. doi:DOI 10.1002/ggge.2006.

Duffy, J. E.,Amaral-Zettler, L. A., Fautin, D. G., Paulay, G., Rynearson, T. A., Sosik, H. M., & Stachowicz, J. J. (2013). “” Bioscience, 63(5), 350-361. doi:DOI 10.1525/bio.2013.63.5..

,Maignien, L.,,Murphy, L. G.,Grim, S. L.,Morrison, H. G., & Sogin, M. L.(2013). “” Methods Ecol Evol, 4(12). doi:10.1111/2041-210X.1211.

,Vineis, J. H.,Morrison, H. G., & Sogin, M. L.(2013). “” PLoS One, 8(6), e66643. doi:10.1371/journal.pone.006664.

Feehery, G. R., Yigit, E., Oyola, S. O., Langhorst, B. W.,Schmidt, V. T., Stewart, F. J., Dimalanta, E. T.,Amaral-Zettler, L. A., Davis, T., Quail, M. A., & Pradhan, S. (2013). “” PLoS One, 8(10), e76096. doi:10.1371/journal.pone.007609.

,, Fredman, D., & (2013). “” Integr Comp Biol, 53(5), 832-846. doi:10.1093/icb/ict09.

Flot, J. F., Hespeels, B., Li, X., Noel, B.,Arkhipova, I. R., Danchin, E. G., Hejnol, A., Henrissat, B., Koszul, R., Aury, J. M., Barbe, V., Barthelemy, R. M., Bast, J., Bazykin, G. A., Chabrol, O., Couloux, A., Da Rocha, M., Da Silva, C., Gladyshev, E., Gouret, P., Hallatschek, O.,Hecox-Lea, B., Labadie, K., Lejeune, B., Piskurek, O., Poulain, J.,Rodriguez, F., Ryan, J. F., Vakhrusheva, O. A., Wajnberg, E., Wirth, B.,Yushenova, I. A., Kellis, M., Kondrashov, A. S.,Mark Welch, D. B., Pontarotti, P., Weissenbach, J., Wincker, P., Jaillon, O., & Van Doninck, K. (2013). “” Nature, 500(7463), 453-457. doi:10.1038/nature1232.

, Eiler, A., Herfort, L., Needoba, J. A., Peterson, T. D., & Crump, B. C. (2013). “” ISME J, 7(10), 1899-1911. doi:10.1038/ismej.2013.7.

Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B.(2013). “” J Gerontol A Biol Sci Med Sci, 68(4), 349-358. doi:10.1093/gerona/gls17.

Gupta, R. W., Tran, L., Norori, J., Ferris, M. J.,, Taylor, C. M., Dowd, S. E., & Penn, D. (2013). “” J Pediatr Gastroenterol Nutr, 56(4), 397-400. doi:10.1097/MPG.0b013e318282a8c.

Hanson, S. J., Schurko, A. M.,Hecox-Lea, B.,Mark Welch, D. B., Stelzer, C. P., & Logsdon, J. M. Jr. (2013). “” J Hered, 104(3), 357-370. doi:10.1093/jhered/est01.

Hanson, S. J., Stelzer, C. P.,Mark Welch, D. B., & Logsdon, J. M. Jr. (2013). “” BMC Genomics, 14, 412. doi:10.1186/1471-2164-14-41.

Helm, R. R., Siebert, S.,,, & Dunn, C. W. (2013). “” BMC Genomics, 14, 266. doi:10.1186/1471-2164-14-26.

Huse, S. M.,Mark Welch, D. B., & Sogin, M. L.(2013). “” 188-207). Institute of Medicine. Washington, DC: The National Academies Press.

Kamennaya, N. A., & Post, A. F.(2013). “” Limnology and Oceanography, 58(6), 1959-1971. doi:DOI 10.4319/lo.2013.58.6.195.

Light, J. E., Hafner, J. C., Upham, N. S., & (2013). “” Journal of Mammalian Evolution, 20(2), 129-146. doi:10.1007/s10914-012-9193-2.

Liu, C. M., Hungate, B. A., Toblan, A. A. R., Serwadda, D., Ravel, J., Lester, R., Kigozi, G., Aziz, M., Galiwango, R. M., Nalugoda, F., Contente-Cuomo, T. L., Wawer, M. J., Kelm, P., Gray, R. H., & Price, L. B. (2013). “” MBio, 4. doi:10.1128/mBio.00076-1.

Maignien, L., Parkes, R. J., Cragg, B., Niemann, H., Knittel, K., Coulon, S., Akhmetzhanov, A., & Boon, N. (2013). “” FEMS Microbiol Ecol, 83(1), 214-231. doi:10.1111/j.1574-6941.2012.01466..

Marteinsson, V. T., Runarsson, A., Stefansson, A., Thorsteinsson, T., Johannesson, T., Magnusson, S. H., Reynisson, E., Einarsson, B., Wade, N.,Morrison, H. G., & Gaidos, E. (2013). “” ISME J, 7(2), 427-437. doi:10.1038/ismej.2012.9.

Materna, S. C., Swartz, S. Z., & (2013). “” Development, 140(8), 1796-1806. doi:10.1242/dev.09115.

McLellan, S. L., Newton, R. J., Vandewalle, J. L., Shanks, O. C.,Huse, S. M.,, & Sogin, M. L.(2013). “” Environ Microbiol, 15(8), 2213-2227. doi:10.1111/1462-2920.1209.

Merkel, A. Y.,, Chernyh, N. A., Bonch-Osmolovskaya, E. A., & Lebedinsky, A. V. (2013). “” Appl Environ Microbiol, 79(3), 915-923. doi:10.1128/AEM.03034-1.

Meyer, J. L.,Akerman, N. H., Proskurowski, G., & (2013). “Microbiological characterization of post-eruption “snowblower” vents at Axial Seamount, Juan de Fuca Ridge.” Front Microbiol, 4, 153. doi:10.3389/fmicb.2013.0015.

Newton, R. J., Bootsma, M. J.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2013). “” Microb Ecol, 65(4), 1011-1023. doi:10.1007/s00248-013-0200-.

Newton, R. J.,Huse, S. M.,Morrison, H. G., Peake, C. S.,Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2013). “” PLoS One, 8(9), e74265. doi:10.1371/journal.pone.007426.

Price, K. E., Hampton, T. H., Gifford, A. H., Dolben, E. L., Hogan, D. A.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., & O’Toole, G. A. (2013). “” Microbiome, 1(1), 27. doi:10.1186/2049-2618-1-2.

Rozhkov, N. V., Schostak, N. G., Zelentsova, E. S.,Yushenova, I. A., Zatsepina, O. G., & Evgen’ev, M. B. (2013). “” Mol Biol Evol, 30(2), 397-408. doi:10.1093/molbev/mss24.

Shanks, O. C., Newton, R. J., Kelty, C. A.,Huse, S. M.,Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2013). “” Appl Environ Microbiol, 79(9), 2906-2913. doi:10.1128/AEM.03448-1.

, Oliver, T. A., Ducklow, H. W.,Amaral-Zettler, L. A., & Sogin, M. L.(2013). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 110(6), 2342-2347. doi:10.1073/pnas.121242411.

Taylor, R. C., Webb Robertson, B. J., Markillie, L. M.,, Linggi, B. E., Aldrich, J. T., Hill, E. A., Romine, M. F., Lipton, M. S., & Wiley, H. S. (2013). “” Integr Biol (Camb), 5(11), 1393-1406. doi:10.1039/c3ib40120.

Theroux, S., Toney, J.,Amaral-Zettler, L. A., & Huang, Y. S. (2013). “” Organic Geochemistry, 62, 68-73. doi:DOI 10.1016/j.orggeochem.2013.07.00.

, Aguiar, D., Istrail, S., & (2013). “” Evodevo, 4(1), 16. doi:10.1186/2041-9139-4-1.

Ver Eecke, H. C.,Akerman, N. H.,, Butterfield, D. A., & Holden, J. F. (2013). “” Environ Microbiol Rep, 5(5), 665-671. doi:10.1111/1758-2229.1206.

Vital, M., Penton, C. R., Wang, Q., Young, V. B., Antonopoulos, D. A.,Sogin, M. L.,Morrison, H. G., Raffals, L., Chang, E. B., Huffnagle, G. B., Schmidt, T. M., Cole, J. R., & Tiedje, J. M. (2013). “” Microbiome, 1(1), 8. doi:10.1186/2049-2618-1-.

Woodring, J. L., Bland, N. D., Ochiana, S. O.,Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2013). “” Bioorg Med Chem Lett, 23(21), 5971-5974. doi:10.1016/j.bmcl.2013.08.05.

Young, V. B., Raffals, L. H.,Huse, S. M., Vital, M., Dai, D., Schloss, P. D., Brulc, J. M., Antonopoulos, D. A., Arrieta, R. L., Kwon, J. H., Reddy, K. G., Hubert, N. A.,Grim, S. L.,Vineis, J. H., Dalal, S.,Morrison, H. G.,, Meyer, F., Schmidt, T. M., Tiedje, J. M., Chang, E. B., & Sogin, M. L.(2013). “” Microbiome, 1(1), 9. doi:10.1186/2049-2618-1-.

Zettler, E. R., Mincer, T. J., & Amaral-Zettler, L. A.(2013). “Life in the “plastisphere”: microbial communities on plastic marine debris.” Environ Sci Technol, 47(13), 7137-7146. doi:10.1021/es401288.

2012

Alliegro, M. C., Hartson, S., & Alliegro, M. A. (2012). “” J Biol Chem, 287(9), 6702-6713. doi:10.1074/jbc.M111.28850.

Amaral-Zettler, L. A.(2012). “” Front Microbiol, 3, 441. doi:10.3389/fmicb.2012.0044.

Arkhipova, I. R.(2012). “” In N. F. Lue & C. Autexier (Ed.), Telomerases: Chemistry, Biology and Clinical Applications (pp. 265-299). Hoboken, NJ: Wiley and Sons, Inc. .

Arkhipova, I. R., Batzer, M. A., Brosius, J., Feschotte, C., Moran, J. V., Schmitz, J., & Jurka, J. (2012). “” Mob DNA, 3(1), 19. doi:10.1186/1759-8753-3-1.

Atamna-Ismaeel, N., Finkel, O. M., Glaser, F., Sharon, I., Schneider, R.,Post, A. F., Spudich, J. L., von Mering, C., Vorholt, J. A., Iluz, D., Beja, O., & Belkin, S. (2012). “” Environ Microbiol, 14(1), 140-146. doi:10.1111/j.1462-2920.2011.02554..

Beg, Q. K., Zampieri, M., Klitgord, N., Collins, S. B., Altafini, C.,, & Segre, D. (2012). “” Nucleic Acids Res, 40(15), 7132-7149. doi:10.1093/nar/gks46.

Bowen, J. L.,Morrison, H. G., Hobbie, J. E., & Sogin, M. L.(2012). “” ISME J, 6(11), 2014-2023. doi:10.1038/ismej.2012.4.

Brandt, B. W., Bonder, M. J.,Huse, S. M., & Zaura, E. (2012). “” Nucleic Acids Res, 40(Web Server issue), W82-87. doi:10.1093/nar/gks41.

Breier, J. A., Gomez-Ibanez, D.,,, & Emerson, D. (2012). “” Deep-Sea Research Part I-Oceanographic Research Papers, 70(0), 83-90. doi:DOI 10.1016/j.dsr.2012.10.00.

Chandsawangbhuwana, C., Shi, L. Z., Zhu, Q., Alliegro, M. C., & Berns, M. W. (2012). “” J Biomed Opt, 17(1), 015001. doi:10.1117/1.JBO.17.1.01500.

Chapman, M., & Alliegro, M. C. (2012). “” Q Rev Biol, 87(4), 315-324.

Crump, B. C.,Amaral-Zettler, L. A., & Kling, G. W. (2012). “” ISME J, 6(9), 1629-1639. doi:10.1038/ismej.2012..

Davies, N., Meyer, C.,,Amaral-Zettler, L. A., Deck, J., Bicak, M., Rocca-Serra, P., Assunta-Sansone, S., Willis, K., & Field, D. (2012). “” Gigascience, 1(1), 5. doi:10.1186/2047-217X-1-.

Filkins, L. M., Hampton, T. H., Gifford, A. H., Gross, M. J., Hogan, D. A.,Sogin, M. L.,Morrison, H. G., Paster, B. J., & O’Toole, G. A. (2012). “” J Bacteriol, 194(17), 4709-4717. doi:10.1128/JB.00566-1.

Finkel, O. M., Burch, A. Y., Elad, T.,Huse, S. M., Lindow, S. E.,Post, A. F., & Belkin, S. (2012). “” Appl Environ Microbiol, 78(17), 6187-6193. doi:10.1128/AEM.00888-1.

 L., & (2012). “” Integr Comp Biol, 52(6), 842-849. doi:10.1093/icb/ics11.

Freitas, S., Hatosy, S., Fuhrman, J. A.,Huse, S. M.,Mark Welch, D. B.,Sogin, M. L., & Martiny, A. C. (2012). “” ISME J, 6(8), 1499-1505. doi:10.1038/ismej.2012..

, Steele, J. A., Caporaso, J. G., Steinbruck, L., Reeder, J., Temperton, B.,Huse, S. M., McHardy, A. C., Knight, R., Joint, I., Somerfield, P., Fuhrman, J. A., & Field, D. (2012). “” ISME J, 6(2), 298-308. doi:10.1038/ismej.2011.10.

Gobet, A., Boer, S. I.,Huse, S. M., van Beusekom, J. E., Quince, C.,Sogin, M. L., Boetius, A., & Ramette, A. (2012). “” ISME J, 6(3), 542-553. doi:10.1038/ismej.2011.13.

Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B.(2012). “” BMC Evol Biol, 12(1), 134. doi:10.1186/1471-2148-12-13.

Huse, S. M., Ye, Y., Zhou, Y., & Fodor, A. A. (2012). “” PLoS One, 7(6), e34242. doi:10.1371/journal.pone.003424.

Kozul-Horvath, C. D., Zandbergen, F., Jackson, B. P., Enelow, R. I., & Hamilton, J. W. (2012). “” PLoS One, 7(5), e38249. doi:10.1371/journal.pone.003824.

Lasek-Nesselquist, E.(2012). “” PLoS One, 7(8), e43554. doi:10.1371/journal.pone.004355.

Looft, T., Johnson, T. A., Allen, H. K., Bayles, D. O., Alt, D. P., Stedtfeld, R. D.,, Stedtfeld, T. M., Chai, B., Cole, J. R., Hashsham, S. A., Tiedje, J. M., & Stanton, T. B. (2012). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 109(5), 1691-1696. doi:10.1073/pnas.112023810.

Mackey, K. R. M., Roberts, K., Lomas, M. W., Saito, M. A.,Post, A. F., & Paytan, A. (2012). “” Environ Sci Technol, 46(19), 10438-10446. doi:10.1021/es300799.

Madan, J. C., Koestler, D. C., Stanton, B. A., Davidson, L., Moulton, L. A., Housman, M. L., Moore, J. H., Guill, M. F.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Hampton, T. H., Karagas, M. R., Palumbo, P. E., Foster, J. A., Hibberd, P. L., & O’Toole, G. A. (2012). “” MBio, 3(4). doi:10.1128/mBio.00251-1.

Madan, J. C., Salari, R. C., Saxena, D., Davidson, L., O’Toole, G. A., Moore, J. H.,Sogin, M. L., Foster, J. A., Edwards, W. H., Palumbo, P., & Hibberd, P. L. (2012). “” Arch Dis Child Fetal Neonatal Ed, 97(6), F456-462. doi:10.1136/fetalneonatal-2011-30137.

McCliment, E. A., Nelson, C. E., Carlson, C. A., Alldredge, A. L., Witting, J., & Amaral-Zettler, L. A.(2012). “” ISME J, 6(2), 309-319. doi:10.1038/ismej.2011.10.

Meeder, E., Mackey, K. R. M., Paytan, A., Shaked, Y., Iluz, D., Stambler, N., Rivlin, T.,Post, A. F., & Lazar, B. (2012). “” Marine Ecology Progress Series, 453, 11-26. doi:10.3354/meps0952.

Ochiana, S. O., Gustafson, A., Bland, N. D., Wang, C., Russo, M. J.,Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2012). “” Part 2. Tadalafil analogs. Bioorg Med Chem Lett, 22(7), 2582-2584. doi:10.1016/j.bmcl.2012.01.11.

Ozok, A. R., Persoon, I. F.,Huse, S. M., Keijser, B. J., Wesselink, P. R., Crielaard, W., & Zaura, E. (2012). “” Int Endod J, 45(6), 530-541. doi:10.1111/j.1365-2591.2011.02006..

Sansone, S. A., Rocca-Serra, P., Field, D., Maguire, E., Taylor, C., Hofmann, O., Fang, H., Neumann, S., Tong, W.,Amaral-Zettler, L. A., Begley, K., Booth, T., Bougueleret, L., Burns, G., Chapman, B., Clark, T., Coleman, L. A., Copeland, J., Das, S., de Daruvar, A., de Matos, P., Dix, I., Edmunds, S., Evelo, C. T., Forster, M. J., Gaudet, P., Gilbert, J., Goble, C., Griffin, J. L., Jacob, D., Kleinjans, J., Harland, L., Haug, K., Hermjakob, H., Ho Sui, S. J., Laederach, A., Liang, S., Marshall, S., McGrath, A., Merrill, E., Reilly, D., Roux, M., Shamu, C. E., Shang, C. A., Steinbeck, C., Trefethen, A., Williams-Jones, B., Wolstencroft, K., Xenarios, I., & Hide, W. (2012). “” Nat Genet, 44(2), 121-126. doi:10.1038/ng.105.

Siam, R., Mustafa, G. A., Sharaf, H., Moustafa, A., Ramadan, A. R., Antunes, A., Bajic, V. B., Stingl, U., Marsis, N. G., Coolen, M. J.,Sogin, M. L., Ferreira, A. J., & Dorry, H. E. (2012). “” PLoS One, 7(8), e42872. doi:10.1371/journal.pone.004287.

Smith, K. F.,Schmidt, V. T., Rosen, G. E., & Amaral-Zettler, L. A.(2012). “” PLoS One, 7(9), e39971. doi:10.1371/journal.pone.003997.

Sogin, M. L.(2012). “” In S. Maloy & R. Kolter (Ed.), Microbes and Evolution: The World That Darwin Never Saw (pp. 31-37). Washington, DC: ASM Press.

Sukenik, A., Kaplan-Levy, R. N.,Mark Welch, J. L., & Post, A. F.(2012). “” ISME J, 6(3), 670-679. doi:10.1038/ismej.2011.12.

Sun, Y., Cai, Y.,Huse, S. M., Knight, R., Farmerie, W. G., Wang, X., & Mai, V. (2012). “” Brief Bioinform, 13(1), 107-121. doi:10.1093/bib/bbr00.

Takumi, K., Swart, A., Mank, T.,Lasek-Nesselquist, E., Lebbad, M., Caccio, S. M., & Sprong, H. (2012). “” Parasit Vectors, 5, 168. doi:10.1186/1756-3305-5-16.

Theroux, S., Huang, Y., & Amaral-Zettler, L. (2012). “” Frontiers in Microbiology, 3, 415.

Toney, J. L., Theroux, S., Andersen, R. A., Coleman, A.,Amaral-Zettler, L. A., & Huang, Y. S. (2012). “” Geochimica Et Cosmochimica Acta, 78, 51-64. doi:DOI 10.1016/j.gca.2011.11.02.

Valm, A. M.,Mark Welch, J. L., & (2012). “” Syst Appl Microbiol, 35(8), 496-502. doi:10.1016/j.syapm.2012.03.00.

Vandewalle, J. L., Goetz, G. W.,Huse, S. M.,Morrison, H. G.,Sogin, M. L., Hoffmann, R. G., Yan, K., & McLellan, S. L. (2012). “” Environ Microbiol, 14(9), 2538-2552. doi:10.1111/j.1462-2920.2012.02757..

Ver Eecke, H. C., Butterfield, D. A.,, Lilley, M. D., Olson, E. J., Roe, K. K., Evans, L. J., Merkel, A. Y., Cantin, H. V., & Holden, J. F. (2012). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 109(34), 13674-13679. doi:10.1073/pnas.120663210.

Wang, C., Ashton, T. D., Gustafson, A., Bland, N. D., Ochiana, S. O.,Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2012). “” Part 1. Sildenafil analogs. Bioorg Med Chem Lett, 22(7), 2579-2581. doi:10.1016/j.bmcl.2012.01.11.

Wolf, B., Schwarzer, A., Cote, A. L., Hampton, T. H., Schwaab, T., Huarte, E., Tomlinson, C. R., Gui, J., Fisher, J. L., Fadul, C. E., Hamilton, J. W., & Ernstoff, M. S. (2012). “” PLoS One, 7(12), e50221. doi:10.1371/journal.pone.005022.

Yager, P. L., Sherrell, R. M., Stammerjohn, S. E., Alderkamp, A. C., Schofield, O., Abrahamsen, E. P., Arrigo, K. R., Bertilsson, S., Garay, D. L., Guerrero, R., Lowry, K. E., Moksnes, P. O., Ndungu, K.,Post, A. F., Randall-Goodwin, E., Riemann, L., Severmann, S., Thatje, S., van Dijken, G. L., & Wilson, S. (2012). “” Oceanography, 25(3), 40-53. doi:.

2011

Agogue, H., Lamy, D., Neal, P. R.,Sogin, M. L., & Herndl, G. J. (2011). “” Mol Ecol, 20(2), 258-274. doi:10.1111/j.1365-294X.2010.04932..

Akerman, N. H., Price, R. E., Pichler, T., & Amend, J. P. (2011). “” Geobiology, 9(5), 436-445. doi:10.1111/j.1472-4669.2011.00291..

Alliegro, M. C. (2011). “” Commun Integr Biol, 4(2), 147-149. doi:10.4161/cib.4.2.1454.

Alliegro, M. C. (2011). “” Chromosome Res, 19(3), 367-376. doi:10.1007/s10577-011-9186-.

Amaral-Zettler, L. A., Zettler, E. R., Theroux, S. M., Palacios, C., Aguilera, A., & Amils, R. (2011). “” ISME J, 5(1), 42-50. doi:10.1038/ismej.2010.10.

Bland, N. D., Wang, C., Tallman, C., Gustafson, A. E., Wang, Z., Ashton, T. D., Ochiana, S. O., McAllister, G., Cotter, K., Fang, A. P., Gechijian, L., Garceau, N., Gangurde, R., Ortenberg, R., Ondrechen, M. J.,Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2011). “” J Med Chem, 54(23), 8188-8194. doi:10.1021/jm201148.

Bogaert, D., Keijser, B.,Huse, S. M., Rossen, J., Veenhoven, R., van Gils, E., Bruin, J., Montijn, R., Bonten, M., & Sanders, E. (2011). “” PLoS One, 6(2), e17035. doi:10.1371/journal.pone.001703.

Bowen, J. L., Ward, B. B.,Morrison, H. G., Hobbie, J. E., Valiela, I., Deegan, L. A., & Sogin, M. L.(2011). “” ISME J, 5(9), 1540-1548. doi:10.1038/ismej.2011.2.

Crielaard, W., Zaura, E., Schuller, A. A.,Huse, S. M., Montijn, R. C., & Keijser, B. J. (2011). “” BMC Med Genomics, 4, 22. doi:10.1186/1755-8794-4-2.

, Zozaya, M., Taylor, C. M., Dowd, S. E., Martin, D. H., & Ferris, M. J. (2011). “” PLoS One, 6(10), e26732. doi:10.1371/journal.pone.002673.

Field, D.,Amaral-Zettler, L. A., Cochrane, G., Cole, J. R., Dawyndt, P., Garrity, G. M., Gilbert, J., Glockner, F. O., Hirschman, L., Karsch-Mizrachi, I., Klenk, H. P., Knight, R., Kottmann, R., Kyrpides, N., Meyer, F., San Gil, I., Sansone, S. A., Schriml, L. M., Sterk, P., Tatusova, T., Ussery, D. W., White, O., & Wooley, J. (2011). “” PLoS Biol, 9(6), e1001088. doi:10.1371/journal.pbio.100108.

Finkel, O. M., Burch, A. Y., Lindow, S. E.,Post, A. F., & Belkin, S. (2011). “” Appl Environ Microbiol, 77(21), 7647-7655. doi:10.1128/AEM.05565-1.

Garbuz, D. G., Astakhova, L. N., Zatsepina, O. G.,Arkhipova, I. R., Nudler, E., & Evgen’ev, M. B. (2011). “” PLoS One, 6(11), e27205. doi:10.1371/journal.pone.002720.

Garbuz, D. G.,Yushenova, I. A., Zatsepina, O. G., Przhiboro, A. A., Bettencourt, B. R., & Evgen’ev, M. B. (2011). “” BMC Evol Biol, 11, 74. doi:10.1186/1471-2148-11-7.

Gast, R. J., Moran, D. M., Dennett, M. R., Wurtsbaugh, W. A., & Amaral-Zettler, L. A.(2011). “” J Water Health, 9(1), 37-52. doi:10.2166/wh.2010.10.

Gladyshev, E. A., & Arkhipova, I. R.(2011). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 108(51), 20311-20316. doi:10.1073/pnas.110026610.

Gribble, K. E., Snell, T. W., & Mark Welch, D. B.(2011). “” Hydrobiologia, 662(1), 35-42. doi:DOI 10.1007/s10750-010-0482-.

Huse, S. M., & Mark Welch, D. (2011). “” J. de Bruijn (Ed.), Handbook of Molecular Microbial Ecology I: Metagenomics and Complementary Approaches (pp. 149-156): Wiley and Sons.

Kamennaya, N. A., & Post, A. F.(2011). “” Appl Environ Microbiol, 77(1), 291-301. doi:10.1128/AEM.01272-1.

Mackey, K. R. M., Bristow, L., Parks, D. R., Altabet, M. A.,Post, A. F., & Paytan, A. (2011). “” Progress in Oceanography, 91(4), 545-560. doi:DOI 10.1016/j.pocean.2011.09.00.

Mark Welch, D. B., & Huse, S. H. (2011). “” In F. J. de Bruijn (Ed.), Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats (pp. 245-252): Wiley and Sons.

Nelson, C. E., Alldredge, A. L., McCliment, E. A.,Amaral-Zettler, L. A., & Carlson, C. A. (2011). “” ISME J, 5(8), 1374-1387. doi:10.1038/ismej.2011.1.

Nuzzio, D. B., Zettler, E. R., Aguilera, A., & Amaral-Zettler, L. A.(2011). “” Sci Total Environ, 409(10), 1984-1989. doi:10.1016/j.scitotenv.2011.01.00.

Oleksiak, M. F., Karchner, S. I., Jenny, M. J., Franks, D. G.,Mark Welch, D. B., & Hahn, M. E. (2011). “” BMC Genomics, 12(1), 263. doi:10.1186/1471-2164-12-26.

Pawlowski, J., Christen, R., Lecroq, B., Bachar, D., Shahbazkia, H. R.,Amaral-Zettler, L. A., & Guillou, L. (2011). “” PLoS One, 6(4), e18169. doi:10.1371/journal.pone.001816.

Perry, D. A.,Morrison, H. G., & Adam, R. D. (2011). “” Mol Biochem Parasitol, 180(2), 112-114. doi:10.1016/j.molbiopara.2011.07.00.

Pollastri, M. P., & Campbell, R. K.(2011). “” Future Med Chem, 3(10), 1307-1315. doi:10.4155/fmc.11.9.

Post, A. F., Penno, S., Zandbank, K., Paytan, A.,Huse, S. M., & Welch, D. M. (2011). “” Front Microbiol, 2, 131. doi:10.3389/fmicb.2011.0013.

Resing, J. A., Rubin, K. H., Embley, R. W., Lupton, J. E., Baker, E. T., Dziak, R. P., Baumberger, T., Lilley, M. D.,, Shank, T. M., Butterfield, D. A., Clague, D. A., Keller, N. S., Merle, S. G., Buck, N. J., Michael, P. J., Soule, A., Caress, D. W., Walker, S. L., Davis, R., Cowen, J. P., Reysenbach, A. L., & Thomas, H. (2011). “” Nature Geoscience, 4(11), 799-806. doi:Doi 10.1038/Ngeo127.

Rodrigues, J. L.,, & Tiedje, J. M. (2011). “” Appl Environ Microbiol, 77(15), 5352-5360. doi:10.1128/AEM.00097-1.

Shanks, O. C., Kelty, C. A., Archibeque, S., Jenkins, M., Newton, R. J., McLellan, S. L.,Huse, S. M., & Sogin, M. L.(2011). “” Appl Environ Microbiol, 77(9), 2992-3001. doi:10.1128/AEM.02988-1.

Shanks, O. C., McLellan, S. L.,Huse, S. M., & Sogin, M. L.(2011). “” . In K. Sen & N. J. Ashbolt (Ed.), In Environmental Microbiology: Current Technology and Water Applications. Norfolk, UK: Caister Academic Press.

Smith, H. A.,Mark Welch, D. B., & Snell, T. W. (2011). “” Hydrobiologia, 662(1), 99-106. doi:10.1007/s10750-010-0484-.

, Morgan, J. R., Zottoli, S. J., Smith, P. J., Buxbaum, J. D., & Bloom, O. E. (2011). “” Biol Bull, 221(1), 18-34.

, Cole, J. R., Jesus Eda, C., Wang, Q., Farris, R. J., Fish, J. A., & Tiedje, J. M. (2011). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 108(35), 14637-14642. doi:10.1073/pnas.111143510.

Valm, A. M.,Mark Welch, J. L., Rieken, C. W.,Hasegawa, Y.,Sogin, M. L., Oldenbourg, R., Dewhirst, F. E., & (2011). “” Proc Natl Acad Sci U S A, 108(10), 4152-4157. doi:10.1073/pnas.110113410.

White, J.,, Hill, G., Hill, E.,Huse, S. M., Weightman, A. J., & Mahenthiralingam, E. (2011). “” Appl Environ Microbiol, 77(13), 4527-4538. doi:10.1128/AEM.02317-1.

Xia, L. C., Steele, J. A., Cram, J. A., Cardon, Z. G.,Simmons, S. L., Vallino, J. J., Fuhrman, J. A., & Sun, F. (2011). “” BMC Syst Biol, 5 Suppl 2, S15. doi:10.1186/1752-0509-5-S2-S1.

Yelton, A. P., Thomas, B. C.,Simmons, S. L., Wilmes, P., Zemla, A., Thelen, M. P., Justice, N., & Banfield, J. F. (2011). “” PLoS Comput Biol, 7(10), e1002230. doi:10.1371/journal.pcbi.100223.

Yilmaz, P.,, Knight, R.,Amaral-Zettler, L. A., Karsch-Mizrachi, I., Cochrane, G., Nakamura, Y., Sansone, S. A., Glockner, F. O., & Field, D. (2011). “” ISME J, 5(10), 1565-1567. doi:10.1038/ismej.2011.3.

Yilmaz, P., Kottmann, R., Field, D., Knight, R., Cole, J. R.,Amaral-Zettler, L. A.,, Karsch-Mizrachi, I., Johnston, A., Cochrane, G., Vaughan, R., Hunter, C., Park, J., Morrison, N., Rocca-Serra, P., Sterk, P., Arumugam, M., Bailey, M., Baumgartner, L., Birren, B. W., Blaser, M. J., Bonazzi, V., Booth, T., Bork, P., Bushman, F. D., Buttigieg, P. L., Chain, P. S., Charlson, E., Costello, E. K., Huot-Creasy, H., Dawyndt, P., DeSantis, T., Fierer, N., Fuhrman, J. A., Gallery, R. E., Gevers, D., Gibbs, R. A., San Gil, I., Gonzalez, A., Gordon, J. I., Guralnick, R., Hankeln, W., Highlander, S., Hugenholtz, P., Jansson, J., Kau, A. L., Kelley, S. T., Kennedy, J., Knights, D., Koren, O., Kuczynski, J., Kyrpides, N., Larsen, R., Lauber, C. L., Legg, T., Ley, R. E., Lozupone, C. A., Ludwig, W., Lyons, D., Maguire, E., Methe, B. A., Meyer, F., Muegge, B., Nakielny, S., Nelson, K. E., Nemergut, D., Neufeld, J. D., Newbold, L. K., Oliver, A. E., Pace, N. R., Palanisamy, G., Peplies, J., Petrosino, J., Proctor, L., Pruesse, E., Quast, C., Raes, J., Ratnasingham, S., Ravel, J., Relman, D. A., Assunta-Sansone, S., Schloss, P. D., Schriml, L., Sinha, R., Smith, M. I., Sodergren, E., Spo, A., Stombaugh, J., Tiedje, J. M., Ward, D. V., Weinstock, G. M., Wendel, D., White, O., Whiteley, A., Wilke, A., Wortman, J. R., Yatsunenko, T., & Glockner, F. O. (2011). “” Nat Biotechnol, 29(5), 415-420. doi:10.1038/nbt.182.

Zinger, L.,Amaral-Zettler, L. A., Fuhrman, J. A., Horner-Devine, M. C.,Huse, S. M.,Mark Welch, D. B., Martiny, J. B.,Sogin, M. L., Boetius, A., & Ramette, A. (2011). “” PLoS One, 6(9), e24570. doi:10.1371/journal.pone.002457.